More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0864 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0864  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 
341 aa  656    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0868  ATP-dependent DNA ligase  99.12 
 
 
341 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0816  ATP-dependent DNA ligase  97.65 
 
 
341 aa  597  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4139  ATP-dependent DNA ligase  55.72 
 
 
345 aa  340  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0092  ATP-dependent DNA ligase  53.21 
 
 
337 aa  315  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3429  ATP-dependent DNA ligase  49.85 
 
 
374 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2700  ATP-dependent DNA ligase  52.78 
 
 
365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5212  ATP-dependent DNA ligase  52.74 
 
 
339 aa  298  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3905  ATP-dependent DNA ligase  50.92 
 
 
341 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603635  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3719  ATP-dependent DNA ligase  50 
 
 
341 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0581582 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4122  ATP-dependent DNA ligase  50.46 
 
 
355 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582664  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4038  ATP-dependent DNA ligase  46.18 
 
 
365 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1947  ATP dependent DNA ligase  43.71 
 
 
359 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5554  ATP dependent DNA ligase  44.88 
 
 
314 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.71197  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5549  ATP-dependent DNA ligase  45.19 
 
 
360 aa  232  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6710  ATP-dependent DNA ligase  44.05 
 
 
346 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00369161  normal  0.292979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4916  ATP-dependent DNA ligase  42.82 
 
 
353 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5005  ATP-dependent DNA ligase  42.82 
 
 
353 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142668  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1585  ATP-dependent DNA ligase  48.69 
 
 
350 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143721  normal  0.0720309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2256  ATP dependent DNA ligase  47.94 
 
 
352 aa  228  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.209492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6355  ATP dependent DNA ligase  43.44 
 
 
361 aa  226  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915888  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0415  ATP dependent DNA ligase  42.94 
 
 
346 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1546  ATP-dependent DNA ligase  43.53 
 
 
369 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5543  ATP-dependent DNA ligase  44.19 
 
 
359 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1254  ATP-dependent DNA ligase  43.7 
 
 
366 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  hitchhiker  0.000397091 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1376  ATP-dependent DNA ligase  43.67 
 
 
360 aa  222  6e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.165882  normal  0.400562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1273  ATP-dependent DNA ligase  43.7 
 
 
351 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13763  ATP-dependent DNA ligase  41.62 
 
 
358 aa  220  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1579  ATP-dependent DNA ligase  44.64 
 
 
358 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0653  ATP-dependent DNA ligase  46.47 
 
 
353 aa  219  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.192766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5820  ATP-dependent DNA ligase  43.31 
 
 
358 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1489  ATP-dependent DNA ligase  42.35 
 
 
369 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199621 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1252  ATP dependent DNA ligase  42.94 
 
 
348 aa  215  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.804327  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4939  ATP-dependent DNA ligase  42.86 
 
 
353 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5027  ATP-dependent DNA ligase  42.86 
 
 
353 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5320  ATP-dependent DNA ligase  42.86 
 
 
353 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0907  ATP-dependent DNA ligase  41.67 
 
 
366 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0826  ATP-dependent DNA ligase  41.28 
 
 
354 aa  209  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4083  ATP-dependent DNA ligase  41.76 
 
 
363 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3859  ATP-dependent DNA ligase  40.23 
 
 
357 aa  205  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4039  ATP dependent DNA ligase  40.72 
 
 
342 aa  195  9e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5866  ATP-dependent DNA ligase  41.76 
 
 
369 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.884257  normal  0.301201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5169  ATP-dependent DNA ligase  38.72 
 
 
408 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00454515  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5292  ATP-dependent DNA ligase  41.21 
 
 
374 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5284  ATP-dependent DNA ligase  41.39 
 
 
311 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15600  ATP-dependent DNA ligase  39.47 
 
 
366 aa  184  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.138561  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1674  ATP dependent DNA ligase  39.88 
 
 
390 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0480  ATP-dependent DNA ligase  38.44 
 
 
371 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4500  ATP dependent DNA ligase  36.04 
 
 
344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4283  ATP dependent DNA ligase  34.88 
 
 
337 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.46921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  33.86 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  34.46 
 
 
495 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  36.89 
 
 
436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  36.36 
 
 
321 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0119  ATP dependent DNA ligase  36.15 
 
 
337 aa  109  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.262895  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4352  DNA polymerase LigD ligase region  38.07 
 
 
313 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  30.65 
 
 
608 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  36.48 
 
 
759 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6253  DNA polymerase LigD ligase subunit  33.43 
 
 
343 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0234052  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20210  DNA polymerase LigD-like ligase domain-containing protein  32.53 
 
 
376 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0459497  normal  0.30843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 
758 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 
758 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2271  ATP dependent DNA ligase  33.94 
 
 
318 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  33.53 
 
 
758 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  33.82 
 
 
816 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  33.99 
 
 
766 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3968  ATP dependent DNA ligase  38.31 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.697199  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  30.06 
 
 
902 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  33.03 
 
 
656 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2814  ATP dependent DNA ligase  33.75 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5282  DNA ligase D  30.25 
 
 
658 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5557  DNA ligase (ATP)  32.21 
 
 
328 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.756283  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  29.66 
 
 
316 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 
763 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  31.66 
 
 
651 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  33.43 
 
 
871 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  32.45 
 
 
320 aa  90.9  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  25.35 
 
 
307 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  34.21 
 
 
508 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  30.23 
 
 
865 aa  89.7  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  31.97 
 
 
939 aa  89.4  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  33.23 
 
 
847 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  34.97 
 
 
845 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  34.29 
 
 
513 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  33.82 
 
 
815 aa  86.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03420  ATP dependent DNA ligase  27.46 
 
 
285 aa  86.3  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  33.54 
 
 
828 aa  85.9  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  31.51 
 
 
797 aa  85.9  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1235  ATP dependent DNA ligase  32.71 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  31.74 
 
 
778 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  28.44 
 
 
861 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  32.69 
 
 
477 aa  84  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6876  ATP dependent DNA ligase  31.14 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  30.31 
 
 
864 aa  84.3  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  32.25 
 
 
901 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  29.13 
 
 
877 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  33.44 
 
 
896 aa  83.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  33.44 
 
 
847 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  31.12 
 
 
845 aa  83.6  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3452  ATP dependent DNA ligase  29.91 
 
 
534 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>