More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1376 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1376  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 360 aa  724    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.165882  normal  0.400562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0826  ATP-dependent DNA ligase  58.52 
 
 		 354 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1254  ATP-dependent DNA ligase  59.25 
 
 		 366 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  hitchhiker  0.000397091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5549  ATP-dependent DNA ligase  59.54 
 
 		 360 aa  391  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13763  ATP-dependent DNA ligase  58.4 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1489  ATP-dependent DNA ligase  56.11 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6710  ATP-dependent DNA ligase  57.31 
 
 		 346 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00369161  normal  0.292979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4939  ATP-dependent DNA ligase  58.65 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5027  ATP-dependent DNA ligase  58.65 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5320  ATP-dependent DNA ligase  58.94 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1546  ATP-dependent DNA ligase  54.65 
 
 		 369 aa  378  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1252  ATP dependent DNA ligase  56.81 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.804327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1947  ATP dependent DNA ligase  53.48 
 
 		 359 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4038  ATP-dependent DNA ligase  52.82 
 
 		 365 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4083  ATP-dependent DNA ligase  54.75 
 
 		 363 aa  357  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3859  ATP-dependent DNA ligase  55.11 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0907  ATP-dependent DNA ligase  53.83 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2256  ATP dependent DNA ligase  56.2 
 
 		 352 aa  348  7e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.209492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1579  ATP-dependent DNA ligase  53.8 
 
 		 358 aa  346  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5820  ATP-dependent DNA ligase  53.41 
 
 		 358 aa  343  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5866  ATP-dependent DNA ligase  53.07 
 
 		 369 aa  338  9e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.884257  normal  0.301201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0480  ATP-dependent DNA ligase  51.4 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1674  ATP dependent DNA ligase  50.67 
 
 		 390 aa  330  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6355  ATP dependent DNA ligase  53.58 
 
 		 361 aa  329  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915888  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0653  ATP-dependent DNA ligase  51.28 
 
 		 353 aa  328  6e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4916  ATP-dependent DNA ligase  49.16 
 
 		 353 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5005  ATP-dependent DNA ligase  49.16 
 
 		 353 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5292  ATP-dependent DNA ligase  53.53 
 
 		 374 aa  328  8e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5169  ATP-dependent DNA ligase  47.88 
 
 		 408 aa  323  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00454515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5543  ATP-dependent DNA ligase  48.47 
 
 		 359 aa  317  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1273  ATP-dependent DNA ligase  47.75 
 
 		 351 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1585  ATP-dependent DNA ligase  52.34 
 
 		 350 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143721  normal  0.0720309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0415  ATP dependent DNA ligase  46.72 
 
 		 346 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4039  ATP dependent DNA ligase  47.71 
 
 		 342 aa  295  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3429  ATP-dependent DNA ligase  44.81 
 
 		 374 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5284  ATP-dependent DNA ligase  48.58 
 
 		 311 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4122  ATP-dependent DNA ligase  43.2 
 
 		 355 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3719  ATP-dependent DNA ligase  44.14 
 
 		 341 aa  262  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0581582 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4139  ATP-dependent DNA ligase  45.58 
 
 		 345 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15600  ATP-dependent DNA ligase  45.79 
 
 		 366 aa  256  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.138561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2700  ATP-dependent DNA ligase  43.37 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0092  ATP-dependent DNA ligase  44.93 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5212  ATP-dependent DNA ligase  42.3 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5554  ATP dependent DNA ligase  45.97 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.71197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3905  ATP-dependent DNA ligase  40.82 
 
 		 341 aa  236  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0816  ATP-dependent DNA ligase  43.96 
 
 		 341 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0868  ATP-dependent DNA ligase  43.3 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0864  ATP-dependent DNA ligase  43.48 
 
 		 341 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4500  ATP dependent DNA ligase  35.37 
 
 		 344 aa  153  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0119  ATP dependent DNA ligase  37.89 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.262895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2271  ATP dependent DNA ligase  35.98 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4283  ATP dependent DNA ligase  33.02 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.46921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  36.9 
 
 		 436 aa  132  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  33.03 
 
 		 495 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  29.46 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  30.11 
 
 		 608 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  32.32 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  33.72 
 
 		 816 aa  112  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  33.13 
 
 		 656 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  30.92 
 
 		 902 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  33.63 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  35.4 
 
 		 828 aa  106  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  35.53 
 
 		 852 aa  105  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  32.14 
 
 		 877 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  33.88 
 
 		 831 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  31.45 
 
 		 766 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  32.63 
 
 		 825 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  31.63 
 
 		 758 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  32.64 
 
 		 845 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  33.33 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  32.61 
 
 		 847 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  25.82 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  31.95 
 
 		 758 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  33.13 
 
 		 858 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  31.95 
 
 		 758 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1649  ATP dependent DNA ligase  35.54 
 
 		 314 aa  99.8  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  33.74 
 
 		 797 aa  99.4  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  33.44 
 
 		 759 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2814  ATP dependent DNA ligase  31.92 
 
 		 358 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20210  DNA polymerase LigD-like ligase domain-containing protein  35.48 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0459497  normal  0.30843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1903  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  36.6 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  31.1 
 
 		 847 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  30.86 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  35.27 
 
 		 603 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  33.94 
 
 		 896 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1305  DNA polymerase LigD ligase region  31.53 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  29.2 
 
 		 871 aa  93.6  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1123  DNA ligase, putative  29.63 
 
 		 309 aa  93.2  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.91674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3452  ATP dependent DNA ligase  31.52 
 
 		 534 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6253  DNA polymerase LigD ligase subunit  29.25 
 
 		 343 aa  92.8  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0234052  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  29.49 
 
 		 763 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  25.81 
 
 		 855 aa  89.7  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  29.14 
 
 		 646 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  28.96 
 
 		 861 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0596  ATP dependent DNA ligase  36.21 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1208  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  35.27 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.433755  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  30.25 
 
 		 845 aa  86.7  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  28.65 
 
 		 867 aa  86.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3968  ATP dependent DNA ligase  36.76 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.697199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  28.61 
 
 		 872 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>