More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4500 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011881  Achl_4500  ATP dependent DNA ligase  100 
 
 		 344 aa  685    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4283  ATP dependent DNA ligase  57.81 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.46921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0119  ATP dependent DNA ligase  49.69 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.262895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2271  ATP dependent DNA ligase  45.21 
 
 		 318 aa  228  8e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2256  ATP dependent DNA ligase  36.45 
 
 		 352 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.209492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6710  ATP-dependent DNA ligase  34.36 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00369161  normal  0.292979 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3859  ATP-dependent DNA ligase  35.21 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4038  ATP-dependent DNA ligase  35.36 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1947  ATP dependent DNA ligase  33.73 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1546  ATP-dependent DNA ligase  33.43 
 
 		 369 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1254  ATP-dependent DNA ligase  33.92 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  hitchhiker  0.000397091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1489  ATP-dependent DNA ligase  33.43 
 
 		 369 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0826  ATP-dependent DNA ligase  32.63 
 
 		 354 aa  167  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4083  ATP-dependent DNA ligase  33.82 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5549  ATP-dependent DNA ligase  32.93 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1252  ATP dependent DNA ligase  34.93 
 
 		 348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.804327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13763  ATP-dependent DNA ligase  34.22 
 
 		 358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1585  ATP-dependent DNA ligase  37.24 
 
 		 350 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143721  normal  0.0720309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0907  ATP-dependent DNA ligase  33.63 
 
 		 366 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1579  ATP-dependent DNA ligase  35.42 
 
 		 358 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5866  ATP-dependent DNA ligase  34.88 
 
 		 369 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.884257  normal  0.301201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4939  ATP-dependent DNA ligase  33.93 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5027  ATP-dependent DNA ligase  33.93 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5320  ATP-dependent DNA ligase  33.93 
 
 		 353 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0480  ATP-dependent DNA ligase  33.62 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3429  ATP-dependent DNA ligase  32.27 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5292  ATP-dependent DNA ligase  36.3 
 
 		 374 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0653  ATP-dependent DNA ligase  33.44 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192766 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1376  ATP-dependent DNA ligase  35.37 
 
 		 360 aa  153  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.165882  normal  0.400562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5820  ATP-dependent DNA ligase  33.04 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5543  ATP-dependent DNA ligase  31.5 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1674  ATP dependent DNA ligase  33.43 
 
 		 390 aa  143  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5169  ATP-dependent DNA ligase  29.13 
 
 		 408 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00454515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4139  ATP-dependent DNA ligase  34.45 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4916  ATP-dependent DNA ligase  30.72 
 
 		 353 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5005  ATP-dependent DNA ligase  30.72 
 
 		 353 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1273  ATP-dependent DNA ligase  30.82 
 
 		 351 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5554  ATP dependent DNA ligase  35.63 
 
 		 314 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.71197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0092  ATP-dependent DNA ligase  33.04 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6355  ATP dependent DNA ligase  30.75 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915888  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0415  ATP dependent DNA ligase  31 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0864  ATP-dependent DNA ligase  35.91 
 
 		 341 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3719  ATP-dependent DNA ligase  33.23 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0581582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2700  ATP-dependent DNA ligase  34.77 
 
 		 365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0868  ATP-dependent DNA ligase  36.53 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0816  ATP-dependent DNA ligase  36.07 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15600  ATP-dependent DNA ligase  31.09 
 
 		 366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.138561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5212  ATP-dependent DNA ligase  32.93 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4122  ATP-dependent DNA ligase  31.38 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4039  ATP dependent DNA ligase  29.75 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3905  ATP-dependent DNA ligase  31.13 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603635  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5284  ATP-dependent DNA ligase  29.69 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  33.94 
 
 		 477 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01736  ATP-dependent DNA ligase  34.38 
 
 		 534 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  30.77 
 
 		 495 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1208  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  38.42 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.433755  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  29.96 
 
 		 545 aa  96.3  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.3 
 
 		 582 aa  95.5  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  34.23 
 
 		 822 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  37.17 
 
 		 847 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  33.47 
 
 		 825 aa  92.4  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  32.47 
 
 		 321 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  31.78 
 
 		 865 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  28.87 
 
 		 902 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  35.6 
 
 		 603 aa  90.1  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  32.77 
 
 		 845 aa  89.7  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  28.16 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3895  ATP-dependent DNA ligase  37.43 
 
 		 551 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2396  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  36.57 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  34.22 
 
 		 436 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  28.96 
 
 		 351 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1305  DNA polymerase LigD ligase region  29.7 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  32 
 
 		 608 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6989  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  35.43 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1040  ATP-dependent DNA ligase  31.88 
 
 		 554 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.081093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1649  ATP dependent DNA ligase  30.59 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  30.13 
 
 		 684 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5528  DNA ligase (ATP)  31.78 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  31.5 
 
 		 552 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5930  DNA ligase (ATP)  31.78 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.030161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0311  ATP-dependent DNA ligase  36.57 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7010  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  34.48 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5331  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  33.71 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3852  ATP dependent DNA ligase  30.87 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5730  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  32.96 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5282  DNA ligase D  32.38 
 
 		 658 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2161  ATP dependent DNA ligase  35.79 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.379865  normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2316  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  35.79 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.84 
 
 		 522 aa  83.6  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  30 
 
 		 656 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  30.23 
 
 		 658 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1903  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  35.48 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4859  ATP-dependent DNA ligase  35.87 
 
 		 551 aa  82.8  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425556  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1462  ATP-dependent DNA ligase  33.7 
 
 		 551 aa  82.8  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0685513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  34.29 
 
 		 544 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3242  DNA ligase D  33.16 
 
 		 657 aa  82.4  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.99209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  32.13 
 
 		 871 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  33.95 
 
 		 532 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  29.08 
 
 		 864 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1541  ATP dependent DNA ligase  35.19 
 
 		 570 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>