More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1208 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1208  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  100 
 
 		 316 aa  624  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.433755  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  52.68 
 
 		 321 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  48.39 
 
 		 831 aa  259  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  48.11 
 
 		 436 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  51.11 
 
 		 477 aa  256  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20210  DNA polymerase LigD-like ligase domain-containing protein  45.05 
 
 		 376 aa  228  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0459497  normal  0.30843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  42.59 
 
 		 495 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  43.38 
 
 		 766 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  43.52 
 
 		 852 aa  209  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  42.63 
 
 		 847 aa  209  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  43.59 
 
 		 797 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  42.09 
 
 		 759 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  42.68 
 
 		 816 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  41.45 
 
 		 763 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  42.99 
 
 		 815 aa  202  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  42.09 
 
 		 758 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  42.09 
 
 		 758 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  42.45 
 
 		 828 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  42.09 
 
 		 758 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  41.58 
 
 		 845 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  36.56 
 
 		 896 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  35.53 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  36.51 
 
 		 863 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  40 
 
 		 778 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  39.41 
 
 		 656 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  37.58 
 
 		 684 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  42.27 
 
 		 847 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1903  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  41.36 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  36.39 
 
 		 867 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  37.78 
 
 		 658 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5528  DNA ligase (ATP)  39.17 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5930  DNA ligase (ATP)  39.17 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.030161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  39.31 
 
 		 858 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  35.19 
 
 		 608 aa  172  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4352  DNA polymerase LigD ligase region  42.68 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0836  DNA ligase D  37.78 
 
 		 683 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5557  DNA ligase (ATP)  38.44 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.756283  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2814  ATP dependent DNA ligase  37.18 
 
 		 358 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  37.35 
 
 		 939 aa  165  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  36.59 
 
 		 351 aa  165  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  34.81 
 
 		 861 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  35.56 
 
 		 882 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  35.67 
 
 		 901 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  36.28 
 
 		 837 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  29.38 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  35.42 
 
 		 871 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3968  ATP dependent DNA ligase  43.31 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.697199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0382  DNA ligase D  34.49 
 
 		 644 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  34.08 
 
 		 865 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  32.91 
 
 		 855 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  34.29 
 
 		 845 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  34.92 
 
 		 847 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  34.55 
 
 		 853 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  35.87 
 
 		 837 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  35.37 
 
 		 818 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6253  DNA polymerase LigD ligase subunit  35.03 
 
 		 343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0234052  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6989  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  35.81 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0596  ATP dependent DNA ligase  37.37 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  35.96 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6876  ATP dependent DNA ligase  35.35 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  35.92 
 
 		 825 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  38.22 
 
 		 896 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  34.7 
 
 		 872 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  34.71 
 
 		 871 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  35.5 
 
 		 822 aa  150  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  34.59 
 
 		 834 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  34.49 
 
 		 833 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  33.86 
 
 		 851 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  36.3 
 
 		 840 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19790  ATP-dependent DNA ligase  37.57 
 
 		 878 aa  145  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  32.28 
 
 		 883 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  31.83 
 
 		 813 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7010  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  35.39 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  34.47 
 
 		 833 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  35.53 
 
 		 847 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  29.97 
 
 		 815 aa  142  7e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  33.33 
 
 		 603 aa  142  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5282  DNA ligase D  33.12 
 
 		 658 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0448  ATP-dependent DNA ligase  32.06 
 
 		 866 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1123  DNA ligase, putative  32.67 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.91674  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1305  DNA polymerase LigD ligase region  35.6 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1235  ATP dependent DNA ligase  34.29 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0353  ATP-dependent DNA ligase  33.12 
 
 		 913 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.344654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  32.83 
 
 		 646 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 866 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  32.91 
 
 		 833 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  35.06 
 
 		 846 aa  138  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2396  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  34.54 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1346  ATP dependent DNA ligase  34.74 
 
 		 936 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.893044  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6483  ATP dependent DNA ligase  34.74 
 
 		 936 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  31.69 
 
 		 902 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  32.21 
 
 		 877 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  34.07 
 
 		 843 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  31.91 
 
 		 954 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5638  ATP-dependent DNA ligase  30.42 
 
 		 882 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  31.79 
 
 		 848 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  35.91 
 
 		 832 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  31.8 
 
 		 940 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2328  putative ATP-dependent DNA ligase  32.7 
 
 		 1001 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455665  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6073  DNA ligase D  34.74 
 
 		 927 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>