More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5866 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5866  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 369 aa  745    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.884257  normal  0.301201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1947  ATP dependent DNA ligase  60.94 
 
 		 359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0826  ATP-dependent DNA ligase  61.54 
 
 		 354 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1252  ATP dependent DNA ligase  61.06 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.804327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3859  ATP-dependent DNA ligase  58.79 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1546  ATP-dependent DNA ligase  55.43 
 
 		 369 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1489  ATP-dependent DNA ligase  55.43 
 
 		 369 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199621 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5549  ATP-dependent DNA ligase  57.89 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1254  ATP-dependent DNA ligase  56.32 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  hitchhiker  0.000397091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4038  ATP-dependent DNA ligase  56.91 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13763  ATP-dependent DNA ligase  54.79 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4939  ATP-dependent DNA ligase  55.56 
 
 		 353 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5027  ATP-dependent DNA ligase  55.56 
 
 		 353 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5320  ATP-dependent DNA ligase  55.83 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6710  ATP-dependent DNA ligase  54.67 
 
 		 346 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00369161  normal  0.292979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2256  ATP dependent DNA ligase  58.24 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.209492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4083  ATP-dependent DNA ligase  55.5 
 
 		 363 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1579  ATP-dependent DNA ligase  56.01 
 
 		 358 aa  371  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0480  ATP-dependent DNA ligase  56.37 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4916  ATP-dependent DNA ligase  52.94 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1273  ATP-dependent DNA ligase  52.41 
 
 		 351 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5005  ATP-dependent DNA ligase  52.94 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5543  ATP-dependent DNA ligase  52.41 
 
 		 359 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0653  ATP-dependent DNA ligase  53.72 
 
 		 353 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0907  ATP-dependent DNA ligase  54.13 
 
 		 366 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5820  ATP-dependent DNA ligase  55.46 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1376  ATP-dependent DNA ligase  53.91 
 
 		 360 aa  362  4e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.165882  normal  0.400562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5169  ATP-dependent DNA ligase  50.38 
 
 		 408 aa  360  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00454515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1674  ATP dependent DNA ligase  52.25 
 
 		 390 aa  352  4e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0415  ATP dependent DNA ligase  50.54 
 
 		 346 aa  349  5e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6355  ATP dependent DNA ligase  52.6 
 
 		 361 aa  341  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915888  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4039  ATP dependent DNA ligase  50 
 
 		 342 aa  325  6e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5292  ATP-dependent DNA ligase  52.53 
 
 		 374 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5284  ATP-dependent DNA ligase  51.2 
 
 		 311 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15600  ATP-dependent DNA ligase  48.32 
 
 		 366 aa  286  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.138561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1585  ATP-dependent DNA ligase  46.11 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143721  normal  0.0720309 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3429  ATP-dependent DNA ligase  43.1 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4122  ATP-dependent DNA ligase  42.2 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5554  ATP dependent DNA ligase  45.01 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.71197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2700  ATP-dependent DNA ligase  41.55 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4139  ATP-dependent DNA ligase  41.96 
 
 		 345 aa  239  8e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3719  ATP-dependent DNA ligase  39.43 
 
 		 341 aa  235  7e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0581582 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5212  ATP-dependent DNA ligase  40.75 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0092  ATP-dependent DNA ligase  40 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3905  ATP-dependent DNA ligase  38.33 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0816  ATP-dependent DNA ligase  41.81 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0864  ATP-dependent DNA ligase  41.64 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0868  ATP-dependent DNA ligase  41.64 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4500  ATP dependent DNA ligase  34.88 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4283  ATP dependent DNA ligase  34.38 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.46921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0119  ATP dependent DNA ligase  37.76 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.262895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2271  ATP dependent DNA ligase  33.82 
 
 		 318 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  30.64 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  27.84 
 
 		 316 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  32.21 
 
 		 847 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  28.32 
 
 		 902 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  32.13 
 
 		 495 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  25.73 
 
 		 307 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  29.43 
 
 		 603 aa  109  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  33.72 
 
 		 436 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1649  ATP dependent DNA ligase  30.91 
 
 		 314 aa  105  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  33.33 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  29.29 
 
 		 858 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  28.45 
 
 		 646 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  30.79 
 
 		 877 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  29.33 
 
 		 847 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.17 
 
 		 582 aa  99  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  29.53 
 
 		 758 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  29.53 
 
 		 758 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  28.49 
 
 		 864 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  27.35 
 
 		 608 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  28.03 
 
 		 871 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  33.2 
 
 		 477 aa  97.1  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  29.21 
 
 		 758 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  33.1 
 
 		 852 aa  96.7  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1123  DNA ligase, putative  28.31 
 
 		 309 aa  96.7  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.91674  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3242  DNA ligase D  30.65 
 
 		 657 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.99209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  29.83 
 
 		 766 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2814  ATP dependent DNA ligase  30.86 
 
 		 358 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0138  ATP dependent DNA ligase  27.21 
 
 		 327 aa  93.2  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.465735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  30.14 
 
 		 763 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4352  DNA polymerase LigD ligase region  30.64 
 
 		 313 aa  92.8  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1903  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  33.45 
 
 		 311 aa  92.8  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  29.07 
 
 		 656 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03420  ATP dependent DNA ligase  31.03 
 
 		 285 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5528  DNA ligase (ATP)  33.72 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5930  DNA ligase (ATP)  33.72 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.030161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  30.28 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  32.34 
 
 		 759 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  29.58 
 
 		 822 aa  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  26.09 
 
 		 865 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1235  ATP dependent DNA ligase  35.19 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  31.2 
 
 		 828 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  25.91 
 
 		 861 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  29.79 
 
 		 584 aa  90.5  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  31.42 
 
 		 584 aa  90.1  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3968  ATP dependent DNA ligase  34.57 
 
 		 312 aa  89.4  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.697199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  32.42 
 
 		 816 aa  89.4  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  26.06 
 
 		 855 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32.43 
 
 		 797 aa  87.4  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>