More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0826 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0826  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 354 aa  726    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3859  ATP-dependent DNA ligase  77.34 
 
 		 357 aa  558  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13763  ATP-dependent DNA ligase  74.44 
 
 		 358 aa  547  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4083  ATP-dependent DNA ligase  75.49 
 
 		 363 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5549  ATP-dependent DNA ligase  74.79 
 
 		 360 aa  541  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4939  ATP-dependent DNA ligase  74.72 
 
 		 353 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5027  ATP-dependent DNA ligase  74.72 
 
 		 353 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5320  ATP-dependent DNA ligase  75 
 
 		 353 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1254  ATP-dependent DNA ligase  73.79 
 
 		 366 aa  537  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  hitchhiker  0.000397091 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5292  ATP-dependent DNA ligase  75.24 
 
 		 374 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1252  ATP dependent DNA ligase  69.71 
 
 		 348 aa  463  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.804327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1947  ATP dependent DNA ligase  62.4 
 
 		 359 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0907  ATP-dependent DNA ligase  64.96 
 
 		 366 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5169  ATP-dependent DNA ligase  57.04 
 
 		 408 aa  431  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00454515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6710  ATP-dependent DNA ligase  63.56 
 
 		 346 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00369161  normal  0.292979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0480  ATP-dependent DNA ligase  63.36 
 
 		 371 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2256  ATP dependent DNA ligase  64.33 
 
 		 352 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.209492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1489  ATP-dependent DNA ligase  59.89 
 
 		 369 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1546  ATP-dependent DNA ligase  59.89 
 
 		 369 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1674  ATP dependent DNA ligase  60.78 
 
 		 390 aa  404  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5866  ATP-dependent DNA ligase  60.33 
 
 		 369 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.884257  normal  0.301201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4038  ATP-dependent DNA ligase  57.78 
 
 		 365 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1376  ATP-dependent DNA ligase  58.52 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.165882  normal  0.400562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5820  ATP-dependent DNA ligase  58.82 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4916  ATP-dependent DNA ligase  54.82 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5005  ATP-dependent DNA ligase  54.82 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5543  ATP-dependent DNA ligase  53.8 
 
 		 359 aa  361  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6355  ATP dependent DNA ligase  55.74 
 
 		 361 aa  360  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915888  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0653  ATP-dependent DNA ligase  53.48 
 
 		 353 aa  354  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1579  ATP-dependent DNA ligase  54.87 
 
 		 358 aa  354  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1273  ATP-dependent DNA ligase  52.73 
 
 		 351 aa  353  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0415  ATP dependent DNA ligase  52.65 
 
 		 346 aa  348  8e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4039  ATP dependent DNA ligase  51.4 
 
 		 342 aa  339  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1585  ATP-dependent DNA ligase  50.59 
 
 		 350 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143721  normal  0.0720309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5284  ATP-dependent DNA ligase  53.4 
 
 		 311 aa  321  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15600  ATP-dependent DNA ligase  48.63 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.138561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3429  ATP-dependent DNA ligase  44.06 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4139  ATP-dependent DNA ligase  45.94 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4122  ATP-dependent DNA ligase  42.65 
 
 		 355 aa  260  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5554  ATP dependent DNA ligase  45.35 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.71197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3719  ATP-dependent DNA ligase  41.12 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0581582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2700  ATP-dependent DNA ligase  42.18 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5212  ATP-dependent DNA ligase  42.6 
 
 		 339 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0092  ATP-dependent DNA ligase  42.9 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3905  ATP-dependent DNA ligase  39.71 
 
 		 341 aa  222  6e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0816  ATP-dependent DNA ligase  41.44 
 
 		 341 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0864  ATP-dependent DNA ligase  41.77 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0868  ATP-dependent DNA ligase  41.88 
 
 		 341 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4500  ATP dependent DNA ligase  32.63 
 
 		 344 aa  167  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4283  ATP dependent DNA ligase  32.93 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.46921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2271  ATP dependent DNA ligase  36.06 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0119  ATP dependent DNA ligase  38.07 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.262895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  29.63 
 
 		 608 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  29.12 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.96 
 
 		 582 aa  116  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  37.9 
 
 		 847 aa  109  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  30.59 
 
 		 877 aa  109  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  32.24 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  33.2 
 
 		 603 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  32.76 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  28.9 
 
 		 902 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  33.08 
 
 		 495 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5528  DNA ligase (ATP)  34.35 
 
 		 329 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5930  DNA ligase (ATP)  34.35 
 
 		 329 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.030161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  34.6 
 
 		 852 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  32.18 
 
 		 828 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  30.84 
 
 		 763 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  31.61 
 
 		 766 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  33.74 
 
 		 477 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  30.77 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  30.09 
 
 		 822 aa  99  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1903  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  32.35 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  29.57 
 
 		 758 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  28.96 
 
 		 861 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  26.38 
 
 		 813 aa  97.1  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  25.64 
 
 		 871 aa  96.3  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  30.95 
 
 		 858 aa  96.7  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  27.19 
 
 		 646 aa  96.3  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  26.01 
 
 		 307 aa  96.3  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  29.87 
 
 		 825 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  30.18 
 
 		 759 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  29.57 
 
 		 758 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  29.57 
 
 		 758 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  30.84 
 
 		 816 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  30.47 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03420  ATP dependent DNA ligase  29.13 
 
 		 285 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  30.26 
 
 		 513 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1208  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  30.41 
 
 		 316 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.433755  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5557  DNA ligase (ATP)  30 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.756283  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20210  DNA polymerase LigD-like ligase domain-containing protein  29.5 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0459497  normal  0.30843 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.87 
 
 		 583 aa  92.4  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.33 
 
 		 522 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  28.45 
 
 		 867 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  28.25 
 
 		 847 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3242  DNA ligase D  27.41 
 
 		 657 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.99209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1649  ATP dependent DNA ligase  29.21 
 
 		 314 aa  91.3  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  35.19 
 
 		 513 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  29.24 
 
 		 656 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4352  DNA polymerase LigD ligase region  33.6 
 
 		 313 aa  90.5  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  25.6 
 
 		 818 aa  90.1  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>