More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2700 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2700  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 365 aa  735    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5212  ATP-dependent DNA ligase  62.54 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3719  ATP-dependent DNA ligase  63.35 
 
 		 341 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0581582 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4122  ATP-dependent DNA ligase  61.28 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4139  ATP-dependent DNA ligase  57.53 
 
 		 345 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3429  ATP-dependent DNA ligase  55.83 
 
 		 374 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0092  ATP-dependent DNA ligase  55.06 
 
 		 337 aa  359  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3905  ATP-dependent DNA ligase  53.21 
 
 		 341 aa  345  8e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0816  ATP-dependent DNA ligase  52.94 
 
 		 341 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0864  ATP-dependent DNA ligase  52.5 
 
 		 341 aa  292  5e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4038  ATP-dependent DNA ligase  48.1 
 
 		 365 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0868  ATP-dependent DNA ligase  52.5 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1947  ATP dependent DNA ligase  44.7 
 
 		 359 aa  278  7e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1489  ATP-dependent DNA ligase  44.66 
 
 		 369 aa  270  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6710  ATP-dependent DNA ligase  45.76 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00369161  normal  0.292979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1546  ATP-dependent DNA ligase  44.1 
 
 		 369 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5820  ATP-dependent DNA ligase  45.33 
 
 		 358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1585  ATP-dependent DNA ligase  46.63 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143721  normal  0.0720309 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6355  ATP dependent DNA ligase  47.2 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915888  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4083  ATP-dependent DNA ligase  45.11 
 
 		 363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2256  ATP dependent DNA ligase  48.97 
 
 		 352 aa  259  7e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.209492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4916  ATP-dependent DNA ligase  45.35 
 
 		 353 aa  255  8e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5005  ATP-dependent DNA ligase  45.35 
 
 		 353 aa  255  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1376  ATP-dependent DNA ligase  43.37 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.165882  normal  0.400562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1254  ATP-dependent DNA ligase  44.51 
 
 		 366 aa  252  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  hitchhiker  0.000397091 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1252  ATP dependent DNA ligase  43.95 
 
 		 348 aa  252  7e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.804327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5549  ATP-dependent DNA ligase  44.05 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4939  ATP-dependent DNA ligase  44.67 
 
 		 353 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5027  ATP-dependent DNA ligase  44.67 
 
 		 353 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5320  ATP-dependent DNA ligase  44.67 
 
 		 353 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0415  ATP dependent DNA ligase  43.03 
 
 		 346 aa  249  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0653  ATP-dependent DNA ligase  45.05 
 
 		 353 aa  247  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1273  ATP-dependent DNA ligase  43.84 
 
 		 351 aa  246  6e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5543  ATP-dependent DNA ligase  42.98 
 
 		 359 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5554  ATP dependent DNA ligase  44.41 
 
 		 314 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.71197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0826  ATP-dependent DNA ligase  42.18 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1579  ATP-dependent DNA ligase  43.8 
 
 		 358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13763  ATP-dependent DNA ligase  42.06 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3859  ATP-dependent DNA ligase  41.35 
 
 		 357 aa  243  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1674  ATP dependent DNA ligase  40.11 
 
 		 390 aa  242  9e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0480  ATP-dependent DNA ligase  41.6 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0907  ATP-dependent DNA ligase  42.12 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5169  ATP-dependent DNA ligase  38.34 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00454515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4039  ATP dependent DNA ligase  42.77 
 
 		 342 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15600  ATP-dependent DNA ligase  43.54 
 
 		 366 aa  226  6e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.138561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5866  ATP-dependent DNA ligase  40.35 
 
 		 369 aa  225  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.884257  normal  0.301201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5284  ATP-dependent DNA ligase  44.82 
 
 		 311 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5292  ATP-dependent DNA ligase  37.94 
 
 		 374 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4500  ATP dependent DNA ligase  34.77 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  34.04 
 
 		 436 aa  119  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  31.31 
 
 		 320 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  32.65 
 
 		 847 aa  112  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4283  ATP dependent DNA ligase  33.74 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.46921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  31.91 
 
 		 495 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  30.37 
 
 		 608 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  29.74 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  30.95 
 
 		 656 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  31 
 
 		 847 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  30.9 
 
 		 861 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  30.68 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  29.52 
 
 		 831 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  31.27 
 
 		 646 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  30.52 
 
 		 684 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  31.44 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2271  ATP dependent DNA ligase  31.29 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  32.69 
 
 		 658 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  30.58 
 
 		 867 aa  99.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  29.34 
 
 		 871 aa  99.8  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4352  DNA polymerase LigD ligase region  34.46 
 
 		 313 aa  99.4  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2814  ATP dependent DNA ligase  30.82 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  30.09 
 
 		 877 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0119  ATP dependent DNA ligase  30.18 
 
 		 337 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.262895  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  25.23 
 
 		 307 aa  96.3  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  30.97 
 
 		 758 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  31.64 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  31.29 
 
 		 758 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  31.29 
 
 		 758 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  27.54 
 
 		 813 aa  94.4  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  28.08 
 
 		 902 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  32.05 
 
 		 513 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1903  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  33.47 
 
 		 311 aa  93.2  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  30.09 
 
 		 818 aa  93.2  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  33.77 
 
 		 603 aa  92.8  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  32.34 
 
 		 513 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.79 
 
 		 539 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  27.69 
 
 		 896 aa  92.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  31.95 
 
 		 513 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.02 
 
 		 583 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  31.64 
 
 		 828 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03420  ATP dependent DNA ligase  28.08 
 
 		 285 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  31.65 
 
 		 816 aa  90.5  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20210  DNA polymerase LigD-like ligase domain-containing protein  29.03 
 
 		 376 aa  90.1  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0459497  normal  0.30843 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6253  DNA polymerase LigD ligase subunit  29.84 
 
 		 343 aa  89.7  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0234052  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  30.87 
 
 		 766 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0836  DNA ligase D  32.58 
 
 		 683 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.7 
 
 		 582 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  29.45 
 
 		 763 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1208  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  30.7 
 
 		 316 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.433755  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0596  ATP dependent DNA ligase  30.25 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  29.27 
 
 		 651 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>