More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1649 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1649  ATP dependent DNA ligase  100 
 
 		 314 aa  636    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0138  ATP dependent DNA ligase  29.54 
 
 		 327 aa  172  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.465735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0596  ATP dependent DNA ligase  40.27 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1123  DNA ligase, putative  31.74 
 
 		 309 aa  149  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.91674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0365  ATP dependent DNA ligase  29.56 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  33.44 
 
 		 495 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  38.52 
 
 		 436 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1903  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  34.11 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6876  ATP dependent DNA ligase  31.25 
 
 		 343 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1208  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  33.91 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.433755  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6253  DNA polymerase LigD ligase subunit  31.27 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0234052  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  27.74 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  29.63 
 
 		 608 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1235  ATP dependent DNA ligase  33.8 
 
 		 311 aa  119  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  27.67 
 
 		 861 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  30.39 
 
 		 845 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3242  DNA ligase D  28.33 
 
 		 657 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.99209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  30.1 
 
 		 864 aa  113  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  28.72 
 
 		 847 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  32.98 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  25.72 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  29.68 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  33.22 
 
 		 822 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  30.46 
 
 		 865 aa  108  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1947  ATP dependent DNA ligase  31.78 
 
 		 359 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  28.37 
 
 		 901 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  32.99 
 
 		 815 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  27.3 
 
 		 896 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20210  DNA polymerase LigD-like ligase domain-containing protein  29.33 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0459497  normal  0.30843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  32.03 
 
 		 847 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  28.15 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4038  ATP-dependent DNA ligase  33.08 
 
 		 365 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  27.85 
 
 		 603 aa  106  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  27.49 
 
 		 646 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  31.71 
 
 		 658 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4352  DNA polymerase LigD ligase region  32.58 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  32.25 
 
 		 656 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  28.25 
 
 		 902 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  29.04 
 
 		 818 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  30.04 
 
 		 882 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  28.37 
 
 		 871 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0353  ATP-dependent DNA ligase  28.32 
 
 		 913 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.344654 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  30.17 
 
 		 825 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  30.03 
 
 		 828 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  28.37 
 
 		 847 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  26.92 
 
 		 872 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  31.56 
 
 		 852 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  31.01 
 
 		 684 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3429  ATP-dependent DNA ligase  26.95 
 
 		 374 aa  99.8  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1376  ATP-dependent DNA ligase  35.54 
 
 		 360 aa  99.8  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.165882  normal  0.400562 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3452  ATP dependent DNA ligase  27.21 
 
 		 534 aa  99.4  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  28.62 
 
 		 851 aa  99  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  25.17 
 
 		 855 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3859  ATP-dependent DNA ligase  27.22 
 
 		 357 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  34.03 
 
 		 477 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0382  DNA ligase D  29.14 
 
 		 644 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5638  ATP-dependent DNA ligase  27.74 
 
 		 882 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  28.16 
 
 		 867 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1546  ATP-dependent DNA ligase  29.02 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3968  ATP dependent DNA ligase  29.9 
 
 		 312 aa  96.7  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.697199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8017  ATP-dependent DNA ligase  28.05 
 
 		 893 aa  96.7  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  29.31 
 
 		 831 aa  96.3  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0653  ATP-dependent DNA ligase  32.34 
 
 		 353 aa  96.3  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  31.05 
 
 		 896 aa  96.3  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  28.05 
 
 		 866 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2814  ATP dependent DNA ligase  31.07 
 
 		 358 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  27.67 
 
 		 881 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1252  ATP dependent DNA ligase  31.17 
 
 		 348 aa  95.1  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.804327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1489  ATP-dependent DNA ligase  30.86 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2328  putative ATP-dependent DNA ligase  28.57 
 
 		 1001 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455665  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1579  ATP-dependent DNA ligase  30.92 
 
 		 358 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4939  ATP-dependent DNA ligase  32.14 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  27.41 
 
 		 883 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  26.53 
 
 		 877 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5027  ATP-dependent DNA ligase  32.14 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5549  ATP-dependent DNA ligase  31.34 
 
 		 360 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1254  ATP-dependent DNA ligase  30.8 
 
 		 366 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  hitchhiker  0.000397091 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  27.15 
 
 		 853 aa  94  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  27.92 
 
 		 940 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  26.04 
 
 		 813 aa  94  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  28.81 
 
 		 954 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  30.52 
 
 		 825 aa  93.6  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5866  ATP-dependent DNA ligase  30.91 
 
 		 369 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.884257  normal  0.301201 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0836  DNA ligase D  29.37 
 
 		 683 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  28.97 
 
 		 939 aa  93.6  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0448  ATP-dependent DNA ligase  27.45 
 
 		 866 aa  93.2  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5320  ATP-dependent DNA ligase  31.75 
 
 		 353 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5528  DNA ligase (ATP)  28.76 
 
 		 329 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5930  DNA ligase (ATP)  28.76 
 
 		 329 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.030161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4772  DNA ligase D  30.4 
 
 		 651 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  28.75 
 
 		 863 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  30.04 
 
 		 837 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  25 
 
 		 815 aa  90.9  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0826  ATP-dependent DNA ligase  29.21 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  28.39 
 
 		 651 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  29.57 
 
 		 833 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1736  ATP-dependent DNA ligase  26.14 
 
 		 888 aa  90.1  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.946456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6710  ATP-dependent DNA ligase  32.18 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00369161  normal  0.292979 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  28.01 
 
 		 843 aa  89  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4083  ATP-dependent DNA ligase  30.23 
 
 		 363 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>