More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0374 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0374  diguanylate cyclase  100 
 
 		 323 aa  624  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1569  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.74 
 
 		 643 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1635  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.74 
 
 		 643 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0651  diguanylate cyclase  39.13 
 
 		 627 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.605256  hitchhiker  0.0000117316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4287  diguanylate cyclase  43.14 
 
 		 409 aa  99  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0539284  normal  0.0529448 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3862  diguanylate cyclase  41.38 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.561764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5063  diguanylate cyclase  42.58 
 
 		 367 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3794  sensory box/GGDEF family protein  33.12 
 
 		 908 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.620688  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3919  diguanylate cyclase  41.83 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.556135 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1237  sensory box protein  35.53 
 
 		 712 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.267434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3506  sensory box/GGDEF family protein  32.47 
 
 		 911 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.143738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3594  sensory box/GGDEF family protein  31.82 
 
 		 911 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3494  sensory box/GGDEF family protein  31.82 
 
 		 911 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0435317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3761  sensory box/GGDEF family protein  31.82 
 
 		 908 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000038986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4490  diguanylate cyclase  31.28 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3879  sensory box/GGDEF family protein  31.82 
 
 		 911 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.12 
 
 		 772 aa  93.6  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3781  sensory box/GGDEF family protein  31.58 
 
 		 910 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.424975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3847  sensory box/ggdef family  32.47 
 
 		 906 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1329  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.95 
 
 		 921 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.600674 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1251  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.95 
 
 		 921 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3059  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.95 
 
 		 921 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.227976  normal  0.0140856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3516  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.52 
 
 		 906 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.80269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1451  sensory box/ggdef family  32.47 
 
 		 914 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000257716 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1751  diguanylate cyclase  30.6 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123921  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1295  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.95 
 
 		 921 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2008  diguanylate cyclase  35.26 
 
 		 574 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1681  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.14 
 
 		 496 aa  90.9  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.650455  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3822  diguanylate cyclase  31.85 
 
 		 358 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1616  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.46 
 
 		 796 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4666  diguanylate cyclase  30.94 
 
 		 407 aa  89.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00608192  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1820  diguanylate cyclase  34.16 
 
 		 443 aa  89.7  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1170  hypothetical protein  27.88 
 
 		 768 aa  89.7  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3329  diguanylate cyclase  36.84 
 
 		 235 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1176  hypothetical protein  27.88 
 
 		 768 aa  89.7  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1689  diguanylate cyclase  35.26 
 
 		 574 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3853  diguanylate cyclase  36.08 
 
 		 482 aa  89.7  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0518051 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0691  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.16 
 
 		 686 aa  89.7  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343759  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4589  diguanylate cyclase  38.56 
 
 		 409 aa  89.4  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35 
 
 		 287 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3330  diguanylate cyclase  31.05 
 
 		 401 aa  89  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.25 
 
 		 550 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3922  GGDEF domain-containing protein  28.67 
 
 		 364 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  29.65 
 
 		 667 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1697  diguanylate cyclase  27.03 
 
 		 762 aa  88.6  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.140109  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1246  diguanylate cyclase  36.91 
 
 		 440 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4960  GGDEF  34.92 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.806512  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0152  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.87 
 
 		 928 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.575219 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 680 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1669  diguanylate cyclase  35.51 
 
 		 499 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3018  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.66 
 
 		 1147 aa  87.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0458  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.3 
 
 		 1037 aa  87.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02626  GGDEF/EAL domain protein  33.53 
 
 		 684 aa  87.4  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0230406  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1864  putative diguanylate cyclase  35.22 
 
 		 882 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327534  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2636  diguanylate cyclase  31.31 
 
 		 220 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128146  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0219  hypothetical protein  32.05 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  30.61 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2673  diguanylate cyclase  36.18 
 
 		 411 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2174  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.44 
 
 		 467 aa  87  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1160  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32 
 
 		 878 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0825  diguanylate cyclase  33.71 
 
 		 594 aa  87  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1481  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.99 
 
 		 949 aa  86.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0538  diguanylate cyclase  37.09 
 
 		 585 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.56 
 
 		 853 aa  86.7  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0525  diguanylate cyclase  36.42 
 
 		 585 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0159  diguanylate cyclase  33.12 
 
 		 368 aa  86.7  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.945874  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1161  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32 
 
 		 878 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.33 
 
 		 577 aa  86.3  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1139  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.36 
 
 		 883 aa  86.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00209756  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2709  GGDEF domain-containing protein  34.64 
 
 		 411 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887365  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0466  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.48 
 
 		 696 aa  86.3  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0862739  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0692  diguanylate cyclase  33.54 
 
 		 422 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0966  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.45 
 
 		 627 aa  85.9  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.533344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0981  diguanylate cyclase  36.42 
 
 		 235 aa  85.9  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.743524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1999  GGDEF domain-containing protein  33.55 
 
 		 292 aa  85.9  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0259  diguanylate cyclase  32.69 
 
 		 339 aa  85.9  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1291  sensory box protein  33.33 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1152  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.94 
 
 		 710 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0872705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0841  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34 
 
 		 715 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.101081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1211  diguanylate cyclase  33.11 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1560  diguanylate cyclase  35.48 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2698  diguanylate cyclase  32.21 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.110295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0796  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.13 
 
 		 765 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.341606 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1231  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32 
 
 		 878 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5656  GGDEF domain-containing protein  34.73 
 
 		 629 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1821  diguanylate cyclase  33.14 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.017871  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65090  hypothetical protein  35.85 
 
 		 673 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05790  transmembrane signal transduction protein  42.74 
 
 		 634 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4670  GGDEF domain-containing protein  34.15 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.406009 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1933  sensory box protein  32.47 
 
 		 692 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0364295  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0219  hypothetical protein  31.41 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6915  diguanylate cyclase  38.67 
 
 		 202 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0028  diguanylate cyclase  30.48 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3437  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.26 
 
 		 684 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3483  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0776435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4391  diguanylate cyclase  37.66 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1694  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.54 
 
 		 1087 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2654  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.36 
 
 		 714 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0977  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.38 
 
 		 657 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.411883  normal  0.0692156 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0679  TPR repeat-containing diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 		 684 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>