More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02266 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  100 
 
 
255 aa  525  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  68.63 
 
 
261 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  57.81 
 
 
258 aa  315  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1324  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  54.15 
 
 
260 aa  295  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00926  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  54.94 
 
 
252 aa  278  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1342  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.25 
 
 
257 aa  229  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3770  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.56 
 
 
252 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1436  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.92 
 
 
257 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2857  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.31 
 
 
265 aa  225  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.49 
 
 
258 aa  224  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  43.8 
 
 
263 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2311  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.53 
 
 
261 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146201  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2696  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.36 
 
 
260 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2860  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.75 
 
 
258 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.24 
 
 
277 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.75 
 
 
252 aa  221  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3917  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.06 
 
 
260 aa  221  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.283072  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0932  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.31 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733087  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3482  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.98 
 
 
261 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.059744  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1544  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  44.92 
 
 
257 aa  219  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0575047  normal  0.138596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.88 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1507  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.14 
 
 
257 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0183743 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.74 
 
 
258 aa  217  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.97 
 
 
258 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1887  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.77 
 
 
260 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0166984  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
258 aa  215  7e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0412678  normal  0.59225 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.36 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.82 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6971  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.32 
 
 
263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1122  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.7 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3859  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.57 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.97 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.97 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0938  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.73 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.58 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3773  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.97 
 
 
258 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.58 
 
 
258 aa  211  9e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.58 
 
 
258 aa  211  9e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.46 
 
 
261 aa  210  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4137  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.19 
 
 
258 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4687  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.17 
 
 
262 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.19 
 
 
252 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734906  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1388  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.63 
 
 
262 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7916  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
260 aa  208  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10310  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.57 
 
 
263 aa  208  9e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.998138  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1408  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.02 
 
 
281 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.38 
 
 
258 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.53 
 
 
265 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1576  putative D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase (BDH) oxidoreductase protein  41.6 
 
 
260 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2585  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.31 
 
 
256 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102816  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.66 
 
 
261 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0826  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.51 
 
 
266 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.162966  hitchhiker  0.000570032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3432  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.68 
 
 
261 aa  206  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.296547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4002  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.44 
 
 
262 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1586  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.92 
 
 
261 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0571917  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.76 
 
 
261 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4364  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.58 
 
 
256 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.76 
 
 
261 aa  205  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.02 
 
 
260 aa  205  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.02 
 
 
261 aa  205  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.47 
 
 
257 aa  204  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4841  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.49 
 
 
251 aa  204  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3554  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.02 
 
 
262 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2498  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.38 
 
 
260 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1386  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.6 
 
 
258 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.15 
 
 
261 aa  202  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3151  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.38 
 
 
260 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0546  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.73 
 
 
258 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8513  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.09 
 
 
254 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.62 
 
 
259 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.0473698 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.18 
 
 
261 aa  201  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1981  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.62 
 
 
259 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.86 
 
 
256 aa  201  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0811  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.31 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110445 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1817  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.02 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1897  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0333934 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1271  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.98 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2140  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.63 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1057  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.6 
 
 
259 aa  199  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660829  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0575  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.86 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.08 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2539  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.53 
 
 
260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.643723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2069  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.77 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343315  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2755  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.08 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137616  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.23 
 
 
261 aa  194  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2854  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.77 
 
 
264 aa  194  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110395  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1572  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.08 
 
 
259 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5331  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.52 
 
 
256 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1682  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.92 
 
 
260 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1807  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.04 
 
 
261 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1665  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.96 
 
 
256 aa  193  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3788  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.1 
 
 
239 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.61 
 
 
258 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1797  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.64 
 
 
260 aa  191  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2705  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.77 
 
 
260 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0392543  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0081  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.84 
 
 
271 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.243269  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6202  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.57 
 
 
260 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.554491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0494  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.56 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 
248 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 
248 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>