More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2729 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  100 
 
 
258 aa  525  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  86.43 
 
 
258 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  87.21 
 
 
258 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  87.21 
 
 
258 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  86.82 
 
 
258 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  86.05 
 
 
262 aa  461  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4137  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  86.43 
 
 
258 aa  461  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3773  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  86.43 
 
 
258 aa  461  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3859  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  86.87 
 
 
259 aa  462  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  85.66 
 
 
258 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3788  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  86.19 
 
 
239 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64758  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  69.32 
 
 
257 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1817  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  65.74 
 
 
261 aa  350  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2140  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  65.74 
 
 
261 aa  350  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1674  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  65.76 
 
 
261 aa  334  7e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.84 
 
 
261 aa  320  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.82 
 
 
252 aa  231  9e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.61 
 
 
252 aa  226  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734906  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1887  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.18 
 
 
260 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0166984  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.91 
 
 
256 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.92 
 
 
265 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2696  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.83 
 
 
260 aa  211  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.49 
 
 
261 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.31 
 
 
261 aa  208  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
258 aa  208  6e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0412678  normal  0.59225 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.31 
 
 
261 aa  208  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.98 
 
 
258 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.58 
 
 
258 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3770  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.02 
 
 
252 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.08 
 
 
261 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.48 
 
 
258 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.35 
 
 
261 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.94 
 
 
258 aa  201  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.87 
 
 
261 aa  201  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2860  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.8 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.3 
 
 
261 aa  199  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.08 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6971  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.86 
 
 
263 aa  195  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.61 
 
 
261 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3554  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.58 
 
 
262 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.7 
 
 
262 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0938  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.48 
 
 
261 aa  192  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1576  putative D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase (BDH) oxidoreductase protein  37.26 
 
 
260 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0826  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.91 
 
 
266 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.162966  hitchhiker  0.000570032 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0811  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.48 
 
 
261 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1324  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.49 
 
 
260 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10030  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.45 
 
 
250 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.84 
 
 
277 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1897  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.85 
 
 
256 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0333934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4002  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.6 
 
 
262 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4687  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41 
 
 
262 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0517  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.89 
 
 
266 aa  188  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1572  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.26 
 
 
259 aa  188  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3432  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41 
 
 
261 aa  188  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.296547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1057  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.57 
 
 
259 aa  188  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660829  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1408  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.61 
 
 
281 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  40.94 
 
 
263 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1388  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.7 
 
 
262 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1386  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.04 
 
 
258 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1807  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.47 
 
 
261 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3482  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.19 
 
 
261 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.059744  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0575  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.64 
 
 
258 aa  185  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.88 
 
 
258 aa  185  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
292 aa  185  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0047  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.61 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0081  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.54 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.243269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0943  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.94 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.801002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00926  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.35 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3079  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.62 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2793  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.44 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313223  normal  0.208363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1271  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.74 
 
 
258 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4364  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.31 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3917  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.5 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.283072  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1682  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.39 
 
 
260 aa  182  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
292 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.31 
 
 
256 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1544  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  39.68 
 
 
257 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0575047  normal  0.138596 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.13 
 
 
258 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1981  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.16 
 
 
259 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
272 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.560148 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.16 
 
 
259 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.0473698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7916  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.86 
 
 
260 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2755  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.11 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137616  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2705  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.08 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0392543  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3166  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17590  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.21 
 
 
257 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0546  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.19 
 
 
258 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1342  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.61 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2718  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.98 
 
 
256 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.158048 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.85 
 
 
260 aa  178  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2585  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.05 
 
 
256 aa  178  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102816  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.45 
 
 
288 aa  178  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1665  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.29 
 
 
256 aa  178  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
255 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2069  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.16 
 
 
256 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343315  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2539  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.11 
 
 
260 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.643723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3073  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.04 
 
 
256 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.789258 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
258 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>