More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8513 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8513  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  100 
 
 
254 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  70.61 
 
 
262 aa  343  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1807  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  69.8 
 
 
261 aa  338  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1797  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  70.2 
 
 
260 aa  332  4e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4841  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  72.13 
 
 
251 aa  330  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0081  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  65.71 
 
 
271 aa  323  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.243269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0047  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  65.71 
 
 
277 aa  319  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7916  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  66.67 
 
 
260 aa  315  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10030  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.45 
 
 
250 aa  311  6.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5331  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.56 
 
 
256 aa  300  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.27 
 
 
248 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.27 
 
 
248 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448544  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.27 
 
 
248 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3917  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  58.37 
 
 
260 aa  295  4e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.283072  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.67 
 
 
243 aa  276  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.66 
 
 
253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.545758  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.92 
 
 
252 aa  263  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235447 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10310  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  54 
 
 
263 aa  261  6.999999999999999e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.998138  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0578  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.57 
 
 
249 aa  260  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0705195 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0366  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  58.37 
 
 
249 aa  259  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  51.19 
 
 
252 aa  250  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3770  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  51.19 
 
 
252 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  49.6 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734906  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  49.81 
 
 
277 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4687  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.59 
 
 
262 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.2 
 
 
258 aa  226  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0412678  normal  0.59225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3554  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.89 
 
 
262 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2755  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.21 
 
 
262 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137616  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1388  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.21 
 
 
262 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1408  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.59 
 
 
281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0938  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.9 
 
 
261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1436  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.27 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2857  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.95 
 
 
265 aa  221  9e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3482  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.4 
 
 
261 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.059744  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  48.39 
 
 
258 aa  219  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.86 
 
 
261 aa  219  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6971  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.08 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1324  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.2 
 
 
260 aa  218  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1507  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.27 
 
 
257 aa  218  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0183743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3432  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.95 
 
 
261 aa  218  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.296547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4002  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.44 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.41 
 
 
261 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.09 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.24 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.24 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.41 
 
 
261 aa  211  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.13 
 
 
261 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.14 
 
 
258 aa  211  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2311  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.75 
 
 
261 aa  211  9e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146201  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1997  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.4 
 
 
259 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2000  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.4 
 
 
259 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.47 
 
 
261 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1342  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.44 
 
 
257 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.44 
 
 
261 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1544  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  43.7 
 
 
257 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0575047  normal  0.138596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1897  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.31 
 
 
256 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0333934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.92 
 
 
260 aa  201  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.53 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  42.21 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2696  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.7 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0932  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.88 
 
 
260 aa  200  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733087  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0811  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.24 
 
 
261 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110445 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1887  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.25 
 
 
260 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0166984  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1386  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.25 
 
 
258 aa  198  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0546  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.02 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346829 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.73 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.08 
 
 
265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.35 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17590  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.49 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2069  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.14 
 
 
256 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343315  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1572  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.68 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.92 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.0473698 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1981  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.92 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0575  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.69 
 
 
258 aa  194  8.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3151  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.02 
 
 
260 aa  194  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2498  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.02 
 
 
260 aa  194  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1271  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.02 
 
 
258 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4364  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
256 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
260 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.88 
 
 
256 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0826  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.76 
 
 
266 aa  193  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.162966  hitchhiker  0.000570032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3073  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.88 
 
 
256 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.789258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2705  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.24 
 
 
260 aa  191  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0392543  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2539  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.47 
 
 
260 aa  191  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.643723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2793  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.69 
 
 
256 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313223  normal  0.208363 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.4 
 
 
250 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2854  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.79 
 
 
264 aa  188  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110395  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
292 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1586  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.15 
 
 
261 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0571917  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2718  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.92 
 
 
256 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.158048 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
292 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1665  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.47 
 
 
256 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1122  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.25 
 
 
263 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
292 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1817  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.19 
 
 
261 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2585  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.78 
 
 
256 aa  185  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2140  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.19 
 
 
261 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1057  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.77 
 
 
259 aa  184  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3286  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.96 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>