More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10310 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_10310  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  100 
 
 
263 aa  529  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.998138  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4841  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  58.8 
 
 
251 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0081  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  57.03 
 
 
271 aa  281  9e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.243269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3917  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  57.09 
 
 
260 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.283072  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0047  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  55.02 
 
 
277 aa  272  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1807  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  52.06 
 
 
261 aa  270  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7916  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  56.97 
 
 
260 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  54.8 
 
 
262 aa  265  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1797  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  52.33 
 
 
260 aa  257  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.8 
 
 
248 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448544  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.8 
 
 
248 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.8 
 
 
248 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10030  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  53.01 
 
 
250 aa  255  6e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8513  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  54 
 
 
254 aa  255  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.28 
 
 
243 aa  251  6e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0366  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  56.35 
 
 
249 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.69 
 
 
252 aa  244  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54 
 
 
253 aa  244  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.545758  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0578  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.5 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0705195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  49.42 
 
 
261 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  49.42 
 
 
261 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  50.38 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2311  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  50.19 
 
 
261 aa  238  5.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146201  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3482  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  49.42 
 
 
261 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.059744  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3554  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  49.42 
 
 
262 aa  237  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  49.43 
 
 
261 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.88 
 
 
277 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0932  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  49.22 
 
 
260 aa  230  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733087  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.71 
 
 
261 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4002  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.91 
 
 
262 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1388  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  48.26 
 
 
262 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  49.04 
 
 
261 aa  225  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6971  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  48.45 
 
 
263 aa  224  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.63 
 
 
255 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3432  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  48.29 
 
 
261 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.296547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1544  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  47.27 
 
 
257 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0575047  normal  0.138596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5331  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.54 
 
 
256 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2857  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  48.05 
 
 
265 aa  222  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1408  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.98 
 
 
281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1436  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.66 
 
 
257 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4687  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.98 
 
 
262 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1507  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.27 
 
 
257 aa  221  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0183743 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2755  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.39 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137616  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1342  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.67 
 
 
257 aa  217  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1887  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.72 
 
 
260 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0166984  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.53 
 
 
261 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1324  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  46 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.09 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0938  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.36 
 
 
261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.44 
 
 
261 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.02 
 
 
258 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  46.12 
 
 
263 aa  208  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2696  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.87 
 
 
260 aa  208  8e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0811  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.8 
 
 
261 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.74 
 
 
256 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3770  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.14 
 
 
252 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.09 
 
 
252 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.67 
 
 
260 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2860  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.92 
 
 
258 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.79 
 
 
258 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4364  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.95 
 
 
256 aa  201  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2498  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.8 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3151  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.8 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2585  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.79 
 
 
256 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102816  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.6 
 
 
265 aa  199  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.96 
 
 
252 aa  198  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734906  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1122  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.96 
 
 
263 aa  198  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.15 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.18 
 
 
258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2069  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.35 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343315  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1897  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.96 
 
 
256 aa  194  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0333934 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.24 
 
 
260 aa  194  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2539  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.4 
 
 
260 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.643723 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.25 
 
 
260 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.89 
 
 
288 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1665  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.38 
 
 
256 aa  191  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3079  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.75 
 
 
257 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2705  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.51 
 
 
260 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0392543  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2854  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.02 
 
 
264 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110395  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1057  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
259 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660829  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1586  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.53 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0571917  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0575  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.8 
 
 
258 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.41 
 
 
261 aa  189  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1674  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.58 
 
 
261 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1386  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.8 
 
 
258 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1572  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.56 
 
 
259 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.92 
 
 
259 aa  188  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.791092  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00926  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.87 
 
 
252 aa  188  8e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0826  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.31 
 
 
266 aa  188  9e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.162966  hitchhiker  0.000570032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17590  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.36 
 
 
257 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1576  putative D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase (BDH) oxidoreductase protein  42.31 
 
 
260 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1592  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.92 
 
 
266 aa  186  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.15 
 
 
262 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3286  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.36 
 
 
256 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.59 
 
 
258 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 
258 aa  186  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0412678  normal  0.59225 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.76 
 
 
258 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1428  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.53 
 
 
266 aa  186  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.818194  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.76 
 
 
258 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0546  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.97 
 
 
258 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>