More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5331 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5331  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  100 
 
 
256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4841  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  64.29 
 
 
251 aa  305  7e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8513  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.97 
 
 
254 aa  305  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1807  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.31 
 
 
261 aa  301  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  58.96 
 
 
262 aa  296  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7916  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  63.97 
 
 
260 aa  295  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1797  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  62.5 
 
 
260 aa  292  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10030  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  57.89 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0081  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  56 
 
 
271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.243269  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.24 
 
 
248 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.24 
 
 
248 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448544  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.24 
 
 
248 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0047  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  53.85 
 
 
277 aa  265  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3917  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  52.61 
 
 
260 aa  256  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.283072  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.24 
 
 
252 aa  255  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235447 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  51.6 
 
 
252 aa  255  5e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.87 
 
 
253 aa  254  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.545758  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  50.8 
 
 
252 aa  251  9.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734906  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0366  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  56.57 
 
 
249 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0578  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  57.89 
 
 
249 aa  245  6e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0705195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.51 
 
 
243 aa  236  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3770  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  48.41 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.22 
 
 
261 aa  228  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10310  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.69 
 
 
263 aa  228  9e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.998138  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.2 
 
 
258 aa  223  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1324  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.97 
 
 
260 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.51 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0412678  normal  0.59225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3482  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.24 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.059744  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1408  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.79 
 
 
281 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 
253 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.36 
 
 
258 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4002  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.02 
 
 
262 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4687  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.63 
 
 
262 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.52 
 
 
255 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2755  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.8 
 
 
262 aa  206  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137616  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1388  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.02 
 
 
262 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3554  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.08 
 
 
262 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.31 
 
 
261 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.31 
 
 
261 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.7 
 
 
261 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.4 
 
 
277 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.64 
 
 
261 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.13 
 
 
258 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6971  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.7 
 
 
263 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.93 
 
 
261 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.35 
 
 
256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2311  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.02 
 
 
261 aa  199  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146201  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.7 
 
 
261 aa  198  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.56 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2696  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.08 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1997  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.47 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2000  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.47 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1436  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.55 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3432  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.47 
 
 
261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.296547 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0932  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.09 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733087  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1544  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  42.91 
 
 
257 aa  195  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0575047  normal  0.138596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2857  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.55 
 
 
265 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0938  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.09 
 
 
261 aa  194  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.7 
 
 
261 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1887  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.7 
 
 
260 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0166984  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.18 
 
 
258 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.62 
 
 
265 aa  192  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1342  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.94 
 
 
257 aa  192  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2860  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.96 
 
 
258 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.36 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1507  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.98 
 
 
257 aa  188  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0183743 
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  41.18 
 
 
263 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0811  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.15 
 
 
261 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110445 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00926  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.82 
 
 
252 aa  186  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.38 
 
 
262 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17590  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.75 
 
 
257 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.38 
 
 
258 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.38 
 
 
258 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.75 
 
 
256 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3773  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.38 
 
 
258 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.38 
 
 
258 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39 
 
 
258 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.76 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.0473698 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1981  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.76 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1897  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.86 
 
 
256 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0333934 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0826  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.33 
 
 
266 aa  179  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.162966  hitchhiker  0.000570032 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39 
 
 
258 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
292 aa  178  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4137  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39 
 
 
258 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3166  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
266 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
292 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
292 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3151  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.08 
 
 
260 aa  175  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2498  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.08 
 
 
260 aa  175  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1817  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.44 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.37 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2140  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.44 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0546  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346829 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3859  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.46 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1122  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.39 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3286  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.19 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1572  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.46 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2718  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.15 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.158048 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1271  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.6 
 
 
258 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>