More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00926 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00926  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  100 
 
 
252 aa  504  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  58.66 
 
 
261 aa  319  3e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  52.76 
 
 
258 aa  300  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  54.94 
 
 
255 aa  298  6e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1324  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  55.73 
 
 
260 aa  293  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.88 
 
 
256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1436  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.43 
 
 
257 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3770  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  49.41 
 
 
252 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.14 
 
 
258 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2857  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.43 
 
 
265 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.88 
 
 
265 aa  221  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1342  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.71 
 
 
257 aa  221  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2311  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.71 
 
 
261 aa  219  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146201  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1507  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.43 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0183743 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2696  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.14 
 
 
260 aa  218  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  43.24 
 
 
263 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0932  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.09 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733087  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3482  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.31 
 
 
261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.059744  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.41 
 
 
258 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.48 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1544  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  43.92 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0575047  normal  0.138596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2860  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.41 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0826  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.75 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.162966  hitchhiker  0.000570032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.36 
 
 
261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.81 
 
 
262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.14 
 
 
277 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.75 
 
 
261 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0938  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.85 
 
 
261 aa  206  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.19 
 
 
261 aa  205  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.19 
 
 
261 aa  205  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1887  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.86 
 
 
260 aa  205  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0166984  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0494  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.03 
 
 
260 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1122  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.36 
 
 
263 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.06 
 
 
252 aa  203  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734906  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4841  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.61 
 
 
251 aa  200  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.97 
 
 
261 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.46 
 
 
258 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.7 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.41 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0811  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.8 
 
 
261 aa  196  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3079  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.13 
 
 
257 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3917  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.83 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.283072  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.57 
 
 
261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2411  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.67 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.520745  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0047  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44 
 
 
277 aa  195  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5564  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.25 
 
 
260 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.91 
 
 
258 aa  194  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1807  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.82 
 
 
261 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0081  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.4 
 
 
271 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.243269  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.76 
 
 
258 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3432  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.7 
 
 
261 aa  193  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.296547 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.34 
 
 
257 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1817  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.88 
 
 
261 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181531  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3859  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40 
 
 
259 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10310  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.02 
 
 
263 aa  192  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.998138  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2140  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.88 
 
 
261 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7916  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.41 
 
 
260 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.58 
 
 
258 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.19 
 
 
258 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.19 
 
 
258 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4002  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40 
 
 
262 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4137  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.98 
 
 
258 aa  191  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.19 
 
 
258 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3773  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.19 
 
 
258 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.87 
 
 
260 aa  190  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.19 
 
 
258 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.8 
 
 
260 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17590  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.14 
 
 
257 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6971  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.61 
 
 
263 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.19 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1388  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.82 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1408  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.82 
 
 
281 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1271  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.37 
 
 
258 aa  188  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3554  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.67 
 
 
262 aa  188  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.55 
 
 
259 aa  188  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.791092  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1997  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.38 
 
 
259 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2000  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.38 
 
 
259 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5331  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.82 
 
 
256 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8513  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.22 
 
 
254 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38590  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.86 
 
 
256 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0379215  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.08 
 
 
260 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1576  putative D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase (BDH) oxidoreductase protein  41.38 
 
 
260 aa  185  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3286  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.47 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1572  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.61 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2585  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.55 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102816  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2718  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.86 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.158048 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0412678  normal  0.59225 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.96 
 
 
258 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4687  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.65 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2264  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.96 
 
 
260 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1797  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.22 
 
 
260 aa  182  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.04 
 
 
260 aa  181  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2539  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.23 
 
 
260 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.643723 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2236  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.55 
 
 
260 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0546  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.41 
 
 
258 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10030  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.4 
 
 
250 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1981  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.46 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.46 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.0473698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2705  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.15 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0392543  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
253 aa  178  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>