More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3917 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3917  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  100 
 
 
260 aa  528  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.283072  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8513  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  58.37 
 
 
254 aa  288  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7916  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.52 
 
 
260 aa  285  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4841  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.61 
 
 
251 aa  285  7e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  57.96 
 
 
262 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1807  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  54.44 
 
 
261 aa  276  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0047  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  56.22 
 
 
277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0081  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  55.24 
 
 
271 aa  270  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.243269  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10310  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  57.09 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.998138  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1797  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  52.33 
 
 
260 aa  268  5e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10030  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  54.84 
 
 
250 aa  254  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448544  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0366  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  56.22 
 
 
249 aa  249  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5331  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  51.41 
 
 
256 aa  248  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
252 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.62 
 
 
253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.545758  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0578  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  56.22 
 
 
249 aa  242  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0705195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3770  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  50.77 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  49.24 
 
 
277 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.09 
 
 
243 aa  235  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.62 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.88 
 
 
258 aa  227  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.66 
 
 
252 aa  226  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734906  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.83 
 
 
261 aa  226  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.06 
 
 
255 aa  225  6e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0811  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  48.46 
 
 
261 aa  222  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4687  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.1 
 
 
262 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1324  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.58 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0412678  normal  0.59225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3554  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.95 
 
 
262 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6971  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.12 
 
 
263 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1887  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.54 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0166984  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1408  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.95 
 
 
281 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1436  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.96 
 
 
257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.63 
 
 
261 aa  215  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.63 
 
 
261 aa  215  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.17 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2857  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.96 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1388  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.79 
 
 
262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4002  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.74 
 
 
262 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.7 
 
 
258 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2311  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.31 
 
 
261 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146201  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.21 
 
 
261 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.94 
 
 
261 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3482  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.17 
 
 
261 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.059744  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.02 
 
 
261 aa  206  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1507  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.41 
 
 
257 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0183743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3432  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.23 
 
 
261 aa  205  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.296547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.38 
 
 
258 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.93 
 
 
261 aa  205  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.36 
 
 
258 aa  205  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2696  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45 
 
 
260 aa  204  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
253 aa  204  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2860  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.7 
 
 
258 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2755  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.63 
 
 
262 aa  202  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137616  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0938  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.7 
 
 
261 aa  202  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0932  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.92 
 
 
260 aa  202  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733087  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2069  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.18 
 
 
256 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343315  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  43.41 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1586  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.4 
 
 
261 aa  195  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0571917  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1544  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  41.57 
 
 
257 aa  194  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0575047  normal  0.138596 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4364  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.8 
 
 
256 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.96 
 
 
262 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2705  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.18 
 
 
260 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0392543  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1342  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.18 
 
 
257 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.98 
 
 
250 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3151  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.24 
 
 
260 aa  192  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2498  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.24 
 
 
260 aa  192  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1572  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.42 
 
 
259 aa  192  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.96 
 
 
258 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.57 
 
 
258 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.57 
 
 
258 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.57 
 
 
258 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.57 
 
 
258 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1997  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.31 
 
 
259 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2000  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.31 
 
 
259 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1271  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.19 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.53 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3773  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.41 
 
 
258 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1817  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.14 
 
 
261 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4137  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.18 
 
 
258 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.05 
 
 
259 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.0473698 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1981  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.05 
 
 
259 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2140  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.14 
 
 
261 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2585  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.42 
 
 
256 aa  188  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102816  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.7 
 
 
256 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1897  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.08 
 
 
256 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0333934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.64 
 
 
265 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.5 
 
 
258 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2854  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.83 
 
 
264 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110395  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
258 aa  185  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2539  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.8 
 
 
260 aa  185  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.643723 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0826  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40 
 
 
266 aa  185  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.162966  hitchhiker  0.000570032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0546  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.96 
 
 
258 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346829 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.02 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.69 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3859  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00926  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.83 
 
 
252 aa  183  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>