More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5299 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
252 aa  511  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.61 
 
 
253 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.545758  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.33 
 
 
248 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448544  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.33 
 
 
248 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.33 
 
 
248 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0366  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  70.61 
 
 
249 aa  321  7e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0578  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  69.8 
 
 
249 aa  317  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0705195 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61.07 
 
 
262 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1807  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.25 
 
 
261 aa  300  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4841  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.73 
 
 
251 aa  293  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0081  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  57.79 
 
 
271 aa  290  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.243269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1797  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.43 
 
 
260 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.02 
 
 
243 aa  287  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10030  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  58.61 
 
 
250 aa  285  5.999999999999999e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0047  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  58.2 
 
 
277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7916  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.27 
 
 
260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8513  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  55.92 
 
 
254 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5331  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  55.24 
 
 
256 aa  262  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3917  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  51 
 
 
260 aa  250  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.283072  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10310  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  54.69 
 
 
263 aa  249  4e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.998138  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  50.2 
 
 
252 aa  237  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3770  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.79 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.41 
 
 
252 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734906  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.99 
 
 
258 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.19 
 
 
258 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0412678  normal  0.59225 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
253 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.31 
 
 
258 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.17 
 
 
261 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.78 
 
 
255 aa  205  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4687  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.8 
 
 
262 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3482  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.31 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.059744  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.78 
 
 
261 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1388  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.64 
 
 
262 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1408  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.41 
 
 
281 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.86 
 
 
258 aa  198  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.31 
 
 
277 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.02 
 
 
261 aa  195  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.32 
 
 
261 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.32 
 
 
261 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.31 
 
 
261 aa  195  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0938  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.02 
 
 
261 aa  194  9e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.47 
 
 
261 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.02 
 
 
261 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1324  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.8 
 
 
260 aa  192  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5564  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.14 
 
 
260 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2411  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.35 
 
 
260 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.520745  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4002  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.91 
 
 
262 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2696  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.08 
 
 
260 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6971  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.93 
 
 
263 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3554  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.54 
 
 
262 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1887  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.86 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0166984  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3432  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.08 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.296547 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.77 
 
 
261 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.58 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2860  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.35 
 
 
258 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  40.62 
 
 
263 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2755  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.7 
 
 
262 aa  186  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137616  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1436  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.39 
 
 
257 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798692 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.02 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1817  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.85 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1271  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.15 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2311  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.55 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146201  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2857  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.39 
 
 
265 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2140  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.46 
 
 
261 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4364  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.61 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.16 
 
 
258 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.76 
 
 
258 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3773  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.16 
 
 
258 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.76 
 
 
258 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0932  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.55 
 
 
260 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733087  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.76 
 
 
258 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.8 
 
 
260 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.25 
 
 
258 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1674  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.92 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.37 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.18 
 
 
257 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2069  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.22 
 
 
256 aa  178  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4137  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.58 
 
 
258 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.19 
 
 
258 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.64 
 
 
258 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.08 
 
 
265 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1507  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.58 
 
 
257 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0183743 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.15 
 
 
260 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1057  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40 
 
 
259 aa  175  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660829  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1342  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.82 
 
 
257 aa  174  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.98 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.0473698 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3151  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.85 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2498  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.85 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1981  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.98 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2705  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.38 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0392543  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3859  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.65 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0811  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.61 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110445 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4270  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.61 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149446  normal  0.650814 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4380  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.61 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209201  normal  0.21753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2854  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.02 
 
 
264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110395  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2539  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.62 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.643723 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
250 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1386  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.22 
 
 
258 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2585  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.04 
 
 
256 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102816  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1572  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.15 
 
 
259 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>