More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1324 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1324  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  100 
 
 
260 aa  531  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  62.2 
 
 
258 aa  330  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  58.33 
 
 
261 aa  318  7e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  54.15 
 
 
255 aa  295  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00926  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  55.56 
 
 
252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.64 
 
 
252 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.49 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3917  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.58 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.283072  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.62 
 
 
258 aa  219  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3770  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.84 
 
 
252 aa  218  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46.46 
 
 
252 aa  217  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734906  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.09 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_003296  RS02396  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.92 
 
 
261 aa  216  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  48 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4380  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.92 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209201  normal  0.21753 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4270  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.92 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149446  normal  0.650814 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.92 
 
 
261 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2696  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.49 
 
 
260 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1887  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.71 
 
 
260 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0166984  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.36 
 
 
259 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.791092  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0494  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.13 
 
 
260 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.48 
 
 
256 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1342  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.23 
 
 
257 aa  209  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1436  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.34 
 
 
257 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2857  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.74 
 
 
265 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3482  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.75 
 
 
261 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.059744  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.88 
 
 
260 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4841  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.58 
 
 
251 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8513  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.2 
 
 
254 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5331  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.97 
 
 
256 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.19 
 
 
265 aa  206  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10310  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  46 
 
 
263 aa  205  6e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.998138  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1797  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.18 
 
 
260 aa  204  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1544  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  42.63 
 
 
257 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0575047  normal  0.138596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0826  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.63 
 
 
266 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.162966  hitchhiker  0.000570032 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1507  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.34 
 
 
257 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0183743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0081  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.76 
 
 
271 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.243269  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2860  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.73 
 
 
258 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1807  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.16 
 
 
261 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5312  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
261 aa  201  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1065  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
262 aa  201  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110057  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2129  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.14 
 
 
262 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213864  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2250  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4982  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0505  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.14 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1428  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.25 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.818194  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2236  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1393  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.13 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0890604  hitchhiker  0.00200504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.34 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.55 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5865  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5564  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.19 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2212  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0021  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
261 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0918  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
262 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.11344  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0018  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
262 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2755  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.08 
 
 
262 aa  199  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137616  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4526  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.35 
 
 
261 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.129874  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1961  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.75 
 
 
265 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.616628  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1408  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.31 
 
 
281 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.13 
 
 
265 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1592  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.86 
 
 
266 aa  199  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.25 
 
 
260 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5146  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.35 
 
 
261 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3125  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.35 
 
 
261 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5713  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.35 
 
 
261 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110704  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0602  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.602337  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.94 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0023  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.39587  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0021  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1651  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.19 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.0473698 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0017  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1447  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1524  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1918  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1981  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.19 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.94 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1167  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0876  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
267 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.462803  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2236  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.27 
 
 
260 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0019  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.35 
 
 
261 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2264  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.27 
 
 
260 aa  198  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.55 
 
 
257 aa  198  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5540  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.96 
 
 
262 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3167  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.96 
 
 
261 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2038  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.35 
 
 
262 aa  198  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1388  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.91 
 
 
262 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1704  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  45.24 
 
 
265 aa  198  7e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
258 aa  198  7.999999999999999e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0412678  normal  0.59225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0047  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.15 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.75 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0932  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.2 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733087  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2311  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.83 
 
 
261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146201  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.94 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1156  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.5 
 
 
258 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.29 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1271  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.69 
 
 
258 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2585  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.7 
 
 
256 aa  195  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102816  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0811  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.35 
 
 
261 aa  195  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110445 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4002  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.8 
 
 
262 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>