More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4787 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448544  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.82 
 
 
253 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.545758  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.33 
 
 
252 aa  362  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235447 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0366  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  74.29 
 
 
249 aa  331  8e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0578  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  72.06 
 
 
249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0705195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0081  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  60 
 
 
271 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.243269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1807  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61.63 
 
 
261 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1797  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  60.82 
 
 
260 aa  298  6e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.11 
 
 
243 aa  297  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2343  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  57.72 
 
 
262 aa  291  9e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0047  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.59 
 
 
277 aa  289  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4841  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  61.22 
 
 
251 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8513  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.27 
 
 
254 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7916  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  59.04 
 
 
260 aa  281  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10030  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  58.61 
 
 
250 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5331  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  55.24 
 
 
256 aa  254  8e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3917  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  50.6 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.283072  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10310  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  52.8 
 
 
263 aa  243  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.998138  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3770  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.04 
 
 
252 aa  226  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1680  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  47.62 
 
 
252 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.509013  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1825  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.58 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00469409  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.65 
 
 
252 aa  208  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734906  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 
253 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0412678  normal  0.59225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.25 
 
 
261 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.94 
 
 
258 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.25 
 
 
255 aa  188  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.06 
 
 
277 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1324  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.8 
 
 
260 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1408  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41 
 
 
281 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5269  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.54 
 
 
261 aa  185  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0932  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.8 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733087  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5564  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  44.14 
 
 
260 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4687  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.23 
 
 
262 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2411  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.18 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.520745  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3482  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.38 
 
 
261 aa  182  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.059744  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1436  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.86 
 
 
257 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798692 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2311  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.78 
 
 
261 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146201  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1388  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.46 
 
 
262 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.41 
 
 
258 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5197  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.15 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.426896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4730  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.15 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2857  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.86 
 
 
265 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1779  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, putative  39.16 
 
 
263 aa  178  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.54 
 
 
260 aa  178  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3009  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.53 
 
 
261 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0803108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0938  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.31 
 
 
261 aa  176  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1750  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.54 
 
 
261 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594296  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6971  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.61 
 
 
263 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4270  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.7 
 
 
261 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149446  normal  0.650814 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4380  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.7 
 
 
261 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209201  normal  0.21753 
 
 
-
 
NC_003296  RS02396  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.24 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.613287  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0494  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.86 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2696  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.15 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1507  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.08 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0183743 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1342  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.67 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1887  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.76 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0166984  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4002  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.31 
 
 
262 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3554  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.26 
 
 
262 aa  172  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4364  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.08 
 
 
256 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4798  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.98 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3432  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.38 
 
 
261 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.296547 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.35 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.96 
 
 
262 aa  171  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.96 
 
 
258 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2755  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.7 
 
 
262 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.137616  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.96 
 
 
258 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4137  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.35 
 
 
258 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.96 
 
 
258 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3773  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.96 
 
 
258 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.58 
 
 
258 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2860  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.52 
 
 
258 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.981149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4591  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.07 
 
 
261 aa  168  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.68 
 
 
265 aa  168  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2069  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.91 
 
 
256 aa  168  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.04 
 
 
256 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4982  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.08 
 
 
261 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1817  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.69 
 
 
261 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181531  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5540  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.41 
 
 
262 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2140  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.69 
 
 
261 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3167  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.08 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1271  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.61 
 
 
258 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.22 
 
 
261 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1674  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.31 
 
 
261 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1544  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  39.06 
 
 
257 aa  165  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0575047  normal  0.138596 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3859  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.82 
 
 
259 aa  165  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.32 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2264  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.22 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1428  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.31 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.818194  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.15 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1997  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.61 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2000  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.61 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1592  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.7 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2250  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.63 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.85 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4526  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  41.31 
 
 
261 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.129874  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>