More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3828 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3828  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 458 aa  884    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191922  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2959  AAA ATPase central domain protein  53.38 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.968368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0875  AAA ATPase central domain protein  41.78 
 
 		 505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  0.497399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2450  AAA ATPase central domain protein  37.06 
 
 		 462 aa  193  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0920957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2172  ATPase central domain-containing protein  37.39 
 
 		 462 aa  192  8e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.25265 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2133  AAA ATPase central domain protein  42.42 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427364  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  29.84 
 
 		 410 aa  107  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  32.34 
 
 		 412 aa  106  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.65 
 
 		 757 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.33 
 
 		 754 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  31.6 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  31.55 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  30.74 
 
 		 465 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  31.84 
 
 		 405 aa  104  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.36 
 
 		 754 aa  104  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  30.85 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.17 
 
 		 754 aa  103  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  36.25 
 
 		 404 aa  103  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1513  ATPase, AAA family protein  30.84 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  34.67 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  29.57 
 
 		 804 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  31.25 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  29.69 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  33.18 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  34.58 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  36.36 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.57 
 
 		 727 aa  102  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.66 
 
 		 677 aa  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  32 
 
 		 412 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  28.35 
 
 		 810 aa  100  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  31.51 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  33.66 
 
 		 407 aa  100  7e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.91 
 
 		 698 aa  99.8  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  27.65 
 
 		 407 aa  100  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.08 
 
 		 805 aa  99.8  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.8 
 
 		 723 aa  99  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  28.62 
 
 		 575 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.41 
 
 		 646 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.88 
 
 		 754 aa  99.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.17 
 
 		 781 aa  99.8  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  37.44 
 
 		 697 aa  99.4  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.12 
 
 		 763 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.03 
 
 		 808 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  31 
 
 		 814 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.51 
 
 		 769 aa  98.6  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.05 
 
 		 616 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.64 
 
 		 616 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.75 
 
 		 781 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.54 
 
 		 768 aa  98.6  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.64 
 
 		 616 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  28.03 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.41 
 
 		 646 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  31.58 
 
 		 575 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  31.08 
 
 		 429 aa  99  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  30.51 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.34 
 
 		 784 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  33.33 
 
 		 684 aa  98.2  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  29.72 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  27.65 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.75 
 
 		 800 aa  97.8  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  31.98 
 
 		 464 aa  97.4  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.03 
 
 		 617 aa  97.1  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  28.66 
 
 		 422 aa  97.1  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  32.02 
 
 		 389 aa  97.1  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  30.05 
 
 		 405 aa  96.3  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  29.71 
 
 		 393 aa  95.9  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.82 
 
 		 625 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.09 
 
 		 742 aa  96.3  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  30.85 
 
 		 613 aa  95.9  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.08 
 
 		 613 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  30.36 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.12 
 
 		 701 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.32 
 
 		 810 aa  95.5  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.42 
 
 		 607 aa  95.5  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.76 
 
 		 667 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  31.58 
 
 		 426 aa  95.5  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  27.34 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.04 
 
 		 805 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  33.79 
 
 		 663 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.23 
 
 		 676 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  32.42 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  31.67 
 
 		 613 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2418  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.87 
 
 		 616 aa  94.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  28.7 
 
 		 722 aa  95.1  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  31.84 
 
 		 404 aa  94.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.93 
 
 		 614 aa  94.4  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.27 
 
 		 732 aa  94.7  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.2 
 
 		 651 aa  94.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.34 
 
 		 640 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  31.78 
 
 		 450 aa  94.4  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  31.58 
 
 		 402 aa  94.4  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  34.78 
 
 		 436 aa  94  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  30.65 
 
 		 696 aa  94.4  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.22 
 
 		 612 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.34 
 
 		 640 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  30.8 
 
 		 704 aa  94.4  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.08 
 
 		 639 aa  94  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  34.65 
 
 		 599 aa  94  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  32.64 
 
 		 623 aa  94  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.25 
 
 		 740 aa  94  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>