More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2959 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2959  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
466 aa  908    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.968368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3828  AAA ATPase central domain protein  53.38 
 
 
458 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191922  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0875  AAA ATPase central domain protein  42.79 
 
 
505 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  0.497399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2450  AAA ATPase central domain protein  35.42 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0920957  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2133  AAA ATPase central domain protein  37.68 
 
 
462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427364  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2172  ATPase central domain-containing protein  34.03 
 
 
462 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.25265 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.68 
 
 
721 aa  107  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  39.69 
 
 
703 aa  107  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.24 
 
 
754 aa  106  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.29 
 
 
754 aa  106  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.36 
 
 
793 aa  106  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  30.49 
 
 
393 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.78 
 
 
727 aa  105  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.06 
 
 
643 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  34.8 
 
 
784 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  35.24 
 
 
760 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  34.8 
 
 
783 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  34.8 
 
 
783 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.36 
 
 
781 aa  103  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  30.9 
 
 
775 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  31.47 
 
 
389 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  30.33 
 
 
386 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  35.38 
 
 
697 aa  102  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.67 
 
 
696 aa  102  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.27 
 
 
671 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.91 
 
 
669 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  32.93 
 
 
682 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  31.73 
 
 
689 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.73 
 
 
754 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  32.81 
 
 
464 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  36.16 
 
 
866 aa  100  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.78 
 
 
794 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.73 
 
 
687 aa  100  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0078  microtubule-severing ATPase  29.39 
 
 
490 aa  100  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.75 
 
 
662 aa  100  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.97 
 
 
798 aa  99.8  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  33.66 
 
 
718 aa  99  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.4 
 
 
684 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.74 
 
 
730 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.07 
 
 
781 aa  99.4  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  30.63 
 
 
387 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.681271 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.46 
 
 
769 aa  98.6  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.61 
 
 
638 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.75 
 
 
672 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.22 
 
 
757 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.22 
 
 
715 aa  99  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.04 
 
 
743 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.8 
 
 
750 aa  98.2  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.21 
 
 
768 aa  98.2  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.6 
 
 
801 aa  98.2  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3546  ATPase central domain-containing protein  35.27 
 
 
443 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  33.96 
 
 
769 aa  97.4  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  30.22 
 
 
645 aa  97.4  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.19 
 
 
659 aa  97.4  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.08 
 
 
704 aa  97.4  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.64 
 
 
723 aa  97.1  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.18 
 
 
677 aa  97.1  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.01 
 
 
784 aa  97.1  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  30.4 
 
 
753 aa  97.1  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  31.51 
 
 
617 aa  96.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  32 
 
 
783 aa  96.7  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  31.51 
 
 
617 aa  96.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  32.31 
 
 
656 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.33 
 
 
685 aa  96.7  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.75 
 
 
669 aa  96.7  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.78 
 
 
640 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.67 
 
 
679 aa  96.7  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  31.43 
 
 
607 aa  96.3  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  28.03 
 
 
713 aa  95.9  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  28.9 
 
 
407 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  34.98 
 
 
654 aa  96.3  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.3 
 
 
781 aa  96.3  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.63 
 
 
732 aa  95.9  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  31.51 
 
 
619 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.23 
 
 
698 aa  96.3  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.04 
 
 
760 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.64 
 
 
608 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  29.67 
 
 
405 aa  95.5  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  28.37 
 
 
754 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.56 
 
 
684 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  31.09 
 
 
617 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.18 
 
 
620 aa  95.1  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.45 
 
 
653 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  27.64 
 
 
499 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.83 
 
 
616 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.45 
 
 
754 aa  94.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.2 
 
 
800 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.67 
 
 
639 aa  94.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.55 
 
 
682 aa  94.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.4 
 
 
625 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  29.78 
 
 
408 aa  94.4  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.49 
 
 
672 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.04 
 
 
642 aa  94  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.14 
 
 
646 aa  94  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  28.9 
 
 
407 aa  93.6  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  36.13 
 
 
703 aa  94  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0309  AAA ATPase  32.73 
 
 
415 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.902003  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.39 
 
 
602 aa  93.6  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.27 
 
 
604 aa  94  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  30.57 
 
 
379 aa  93.6  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>