More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2450 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2450  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 462 aa  939    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0920957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2133  AAA ATPase central domain protein  85.06 
 
 		 462 aa  805    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427364  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2172  ATPase central domain-containing protein  93.51 
 
 		 462 aa  884    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.25265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0875  AAA ATPase central domain protein  34.91 
 
 		 505 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  0.497399 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2959  AAA ATPase central domain protein  36.55 
 
 		 466 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.968368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3828  AAA ATPase central domain protein  37.06 
 
 		 458 aa  193  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191922  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_002936  DET1513  ATPase, AAA family protein  30.1 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.75 
 
 		 805 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  31.74 
 
 		 575 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  31.3 
 
 		 575 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  30.47 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  32.68 
 
 		 760 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  29.96 
 
 		 577 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.68 
 
 		 781 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  31.53 
 
 		 788 aa  97.8  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  33.33 
 
 		 421 aa  97.8  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  33.67 
 
 		 703 aa  97.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.5 
 
 		 801 aa  97.1  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.76 
 
 		 755 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.86 
 
 		 673 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.86 
 
 		 673 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.09 
 
 		 793 aa  96.3  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 		 640 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 		 640 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0215  vesicle-fusing ATPase  35.58 
 
 		 513 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  32.68 
 
 		 784 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.85 
 
 		 794 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.66 
 
 		 805 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.42 
 
 		 642 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.19 
 
 		 643 aa  94.4  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  31.63 
 
 		 407 aa  94.4  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  28.14 
 
 		 673 aa  94.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.42 
 
 		 642 aa  94  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.42 
 
 		 642 aa  94  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.42 
 
 		 640 aa  94  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  27.34 
 
 		 389 aa  94  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.52 
 
 		 798 aa  94  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.53 
 
 		 641 aa  93.2  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  30.89 
 
 		 405 aa  93.2  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1351  M41 family peptidase  30.05 
 
 		 558 aa  93.2  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000179169  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0674  Adenosinetriphosphatase  31.66 
 
 		 737 aa  93.2  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.444846  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.89 
 
 		 640 aa  93.2  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  32.28 
 
 		 783 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.6 
 
 		 760 aa  93.2  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  32.28 
 
 		 783 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2393  FtsH peptidase  32.62 
 
 		 619 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00023499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  27.8 
 
 		 640 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  33.71 
 
 		 764 aa  92.8  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.56 
 
 		 638 aa  92.8  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.14 
 
 		 628 aa  92.8  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0857  atpase ec atp-dependent Zn protease  31.96 
 
 		 556 aa  92.8  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  33.73 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.56 
 
 		 643 aa  92  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.92 
 
 		 643 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.92 
 
 		 648 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.72 
 
 		 638 aa  92  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  33.91 
 
 		 645 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.17 
 
 		 756 aa  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  30.88 
 
 		 393 aa  91.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30 
 
 		 781 aa  91.7  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  31.67 
 
 		 617 aa  91.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.11 
 
 		 641 aa  91.3  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  30.84 
 
 		 681 aa  91.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  35.29 
 
 		 633 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1068  putative cell division protease FtsH-like protein  31.13 
 
 		 556 aa  91.7  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.427704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  33.72 
 
 		 638 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.29 
 
 		 633 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.1 
 
 		 704 aa  91.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  33.72 
 
 		 640 aa  90.9  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.72 
 
 		 638 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  31.03 
 
 		 426 aa  90.9  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.72 
 
 		 638 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.72 
 
 		 638 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0749  vesicle-fusing ATPase  31.96 
 
 		 742 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 		 645 aa  90.5  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  30.73 
 
 		 646 aa  90.5  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  30.43 
 
 		 619 aa  90.5  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.72 
 
 		 638 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.57 
 
 		 742 aa  90.1  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.75 
 
 		 651 aa  90.1  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  29.49 
 
 		 623 aa  90.1  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  32.75 
 
 		 649 aa  90.1  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.16 
 
 		 577 aa  90.1  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  28.87 
 
 		 408 aa  90.1  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  32.75 
 
 		 644 aa  90.1  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.28 
 
 		 679 aa  90.1  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.67 
 
 		 644 aa  90.1  8e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7198  Microtubule-severing ATPase  33.53 
 
 		 663 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0849577  normal  0.0429658 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.78 
 
 		 684 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  29.86 
 
 		 651 aa  89.7  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  31.58 
 
 		 499 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.04 
 
 		 613 aa  89.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  31.82 
 
 		 632 aa  89.4  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10440  ATPase  32 
 
 		 728 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  30.62 
 
 		 747 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38163  predicted protein  31.36 
 
 		 800 aa  89.7  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158186  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 		 810 aa  89.4  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.71 
 
 		 633 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.66 
 
 		 731 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.45 
 
 		 633 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>