More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0875 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0875  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 505 aa  1009    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  0.497399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3828  AAA ATPase central domain protein  41.05 
 
 		 458 aa  277  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191922  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2959  AAA ATPase central domain protein  43.14 
 
 		 466 aa  272  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.968368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2172  ATPase central domain-containing protein  38.19 
 
 		 462 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.25265 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2450  AAA ATPase central domain protein  34.91 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0920957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2133  AAA ATPase central domain protein  38.64 
 
 		 462 aa  212  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427364  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  32.31 
 
 		 407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  31.42 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  32.17 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.08 
 
 		 727 aa  105  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1513  ATPase, AAA family protein  28.12 
 
 		 431 aa  104  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  31.25 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  30.91 
 
 		 393 aa  103  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0113  ATP-dependent zinc metallopeptidase - cell division protein  31.14 
 
 		 715 aa  102  1e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.08 
 
 		 723 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  29 
 
 		 443 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.27 
 
 		 754 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  33.66 
 
 		 426 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  32.14 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  32.99 
 
 		 413 aa  101  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  35.02 
 
 		 613 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.13 
 
 		 808 aa  101  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  36.54 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  35.82 
 
 		 696 aa  100  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  33.51 
 
 		 410 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  33.84 
 
 		 404 aa  100  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 		 810 aa  100  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.46 
 
 		 773 aa  99.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  31.22 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  34.83 
 
 		 412 aa  99  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  31.22 
 
 		 450 aa  99.4  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.38 
 
 		 801 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  33.51 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.9 
 
 		 800 aa  99  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.47 
 
 		 784 aa  98.2  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.8 
 
 		 737 aa  98.2  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  29.96 
 
 		 393 aa  97.8  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  30.05 
 
 		 386 aa  97.8  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  34.31 
 
 		 798 aa  97.8  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  31.82 
 
 		 404 aa  97.8  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  34.84 
 
 		 400 aa  97.4  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.2 
 
 		 793 aa  97.4  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  30.93 
 
 		 407 aa  97.4  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  29.18 
 
 		 387 aa  97.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  30.89 
 
 		 389 aa  97.4  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  36 
 
 		 405 aa  97.1  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.04 
 
 		 781 aa  97.1  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.4 
 
 		 625 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.21 
 
 		 679 aa  96.7  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.93 
 
 		 657 aa  97.1  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.68 
 
 		 671 aa  96.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  35.76 
 
 		 412 aa  96.7  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.42 
 
 		 738 aa  96.7  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.74 
 
 		 806 aa  96.7  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  27.8 
 
 		 438 aa  96.7  9e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  35.68 
 
 		 684 aa  96.7  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  34.48 
 
 		 421 aa  96.7  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  30.93 
 
 		 407 aa  96.7  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  31.49 
 
 		 447 aa  96.3  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  35.38 
 
 		 760 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.03 
 
 		 730 aa  96.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  31.44 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  34.27 
 
 		 739 aa  96.3  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.1 
 
 		 662 aa  96.3  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.3 
 
 		 757 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  33.33 
 
 		 417 aa  95.5  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  30.7 
 
 		 607 aa  95.5  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.89 
 
 		 769 aa  95.5  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  30.46 
 
 		 464 aa  95.1  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  33.67 
 
 		 718 aa  95.9  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  30.41 
 
 		 407 aa  95.9  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  28.98 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.71 
 
 		 672 aa  95.9  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  31.79 
 
 		 405 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.45 
 
 		 781 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.91 
 
 		 754 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  31.14 
 
 		 443 aa  94.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.87 
 
 		 736 aa  94.7  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  28.25 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  33.16 
 
 		 412 aa  95.1  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  27.88 
 
 		 284 aa  94.7  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.47 
 
 		 659 aa  95.1  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  30.73 
 
 		 810 aa  94.7  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  29.83 
 
 		 803 aa  94.7  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  29.32 
 
 		 407 aa  94.7  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.03 
 
 		 781 aa  94.4  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.82 
 
 		 672 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.98 
 
 		 721 aa  94.4  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  35.51 
 
 		 654 aa  94.7  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  35.86 
 
 		 656 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  29.07 
 
 		 389 aa  94.4  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  27.43 
 
 		 434 aa  94.4  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.41 
 
 		 651 aa  94.4  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0215  vesicle-fusing ATPase  33.2 
 
 		 513 aa  94.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  36.63 
 
 		 681 aa  94  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.07 
 
 		 698 aa  94  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.44 
 
 		 737 aa  94  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.32 
 
 		 669 aa  93.6  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.32 
 
 		 671 aa  93.6  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 		 760 aa  93.6  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>