More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2133 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2133  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 462 aa  934    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427364  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2450  AAA ATPase central domain protein  85.06 
 
 		 462 aa  805    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0920957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2172  ATPase central domain-containing protein  84.85 
 
 		 462 aa  803    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.25265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0875  AAA ATPase central domain protein  38.17 
 
 		 505 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  0.497399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3828  AAA ATPase central domain protein  42.42 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191922  normal  0.0134445 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2959  AAA ATPase central domain protein  36.93 
 
 		 466 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.968368 
 
 
-
 
NC_002936  DET1513  ATPase, AAA family protein  26.68 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.86 
 
 		 805 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  32.6 
 
 		 577 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.12 
 
 		 756 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  31.58 
 
 		 575 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  31.14 
 
 		 575 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  31.67 
 
 		 617 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.24 
 
 		 640 aa  98.6  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2393  FtsH peptidase  32.13 
 
 		 619 aa  99  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00023499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  33.33 
 
 		 421 aa  98.2  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.87 
 
 		 610 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.67 
 
 		 628 aa  98.2  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  30.36 
 
 		 638 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.47 
 
 		 643 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.47 
 
 		 648 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.78 
 
 		 643 aa  97.8  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.24 
 
 		 642 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.24 
 
 		 642 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.24 
 
 		 642 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  32.06 
 
 		 640 aa  97.8  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.24 
 
 		 640 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.58 
 
 		 638 aa  97.8  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  33.97 
 
 		 798 aa  97.8  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.78 
 
 		 640 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.78 
 
 		 640 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.41 
 
 		 610 aa  97.4  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  34.3 
 
 		 681 aa  97.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.65 
 
 		 801 aa  97.1  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.04 
 
 		 638 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.04 
 
 		 638 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.19 
 
 		 684 aa  97.1  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  33.5 
 
 		 646 aa  96.7  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.06 
 
 		 638 aa  97.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  31.28 
 
 		 637 aa  97.1  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.04 
 
 		 638 aa  96.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.29 
 
 		 641 aa  96.7  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.63 
 
 		 755 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.6 
 
 		 805 aa  96.3  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  31.71 
 
 		 644 aa  95.5  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  30.93 
 
 		 803 aa  95.5  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  31.71 
 
 		 649 aa  95.5  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  30.73 
 
 		 718 aa  95.1  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.46 
 
 		 640 aa  95.5  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  31.71 
 
 		 760 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.36 
 
 		 626 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.3 
 
 		 781 aa  95.5  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.1 
 
 		 643 aa  95.5  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.3 
 
 		 651 aa  95.5  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.13 
 
 		 794 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.91 
 
 		 640 aa  94.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.08 
 
 		 793 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  34.3 
 
 		 645 aa  94.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.91 
 
 		 638 aa  94.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.49 
 
 		 781 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  35.94 
 
 		 763 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 		 810 aa  94.4  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0215  vesicle-fusing ATPase  33.5 
 
 		 513 aa  94.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.75 
 
 		 736 aa  94  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  33.01 
 
 		 656 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  30.14 
 
 		 402 aa  94  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.16 
 
 		 656 aa  94  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  33.53 
 
 		 764 aa  93.6  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.82 
 
 		 672 aa  94  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26133  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  30.74 
 
 		 677 aa  93.6  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.84 
 
 		 641 aa  93.6  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  30.34 
 
 		 689 aa  93.6  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.69 
 
 		 679 aa  93.6  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.39 
 
 		 608 aa  93.2  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  34.48 
 
 		 633 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.48 
 
 		 633 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  31.66 
 
 		 722 aa  93.2  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  31.39 
 
 		 499 aa  93.2  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.96 
 
 		 671 aa  93.2  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.27 
 
 		 633 aa  93.2  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  32.82 
 
 		 703 aa  92.8  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.01 
 
 		 759 aa  92.8  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.65 
 
 		 669 aa  92.8  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1068  putative cell division protease FtsH-like protein  31.46 
 
 		 556 aa  92.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.427704  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  27.87 
 
 		 754 aa  93.2  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.52 
 
 		 697 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.3 
 
 		 645 aa  93.2  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.91 
 
 		 687 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0998  FtsH peptidase  33.92 
 
 		 632 aa  92.8  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.438302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  31.74 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.52 
 
 		 697 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.06 
 
 		 738 aa  92.8  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  30.58 
 
 		 673 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2884  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.88 
 
 		 623 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402765  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.84 
 
 		 732 aa  92.8  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  30.74 
 
 		 700 aa  92  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  31.37 
 
 		 704 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  30.47 
 
 		 623 aa  92  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.85 
 
 		 510 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.19 
 
 		 757 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>