More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1513 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1513  ATPase, AAA family protein  100 
 
 
431 aa  887    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16182  predicted protein  37.82 
 
 
514 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0647858  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.04 
 
 
640 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.87 
 
 
638 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.04 
 
 
642 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.04 
 
 
642 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.24 
 
 
616 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.59 
 
 
642 aa  126  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.62 
 
 
650 aa  125  1e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0453  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.4 
 
 
653 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.68 
 
 
616 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  35.68 
 
 
640 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0278  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.68 
 
 
616 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.71 
 
 
638 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  36.23 
 
 
640 aa  124  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  35.68 
 
 
640 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  36.59 
 
 
638 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  35.27 
 
 
639 aa  123  6e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.44 
 
 
635 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.07 
 
 
640 aa  123  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3755  FtsH peptidase  35.81 
 
 
613 aa  123  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29118  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  30.89 
 
 
632 aa  123  7e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.59 
 
 
638 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.59 
 
 
638 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2318  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.09 
 
 
633 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0771513  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.06 
 
 
602 aa  123  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0665  membrane protease FtsH catalytic subunit  35.09 
 
 
633 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735845  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.59 
 
 
638 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.62 
 
 
646 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.62 
 
 
646 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0566  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.09 
 
 
633 aa  123  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  35.44 
 
 
627 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.2 
 
 
666 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4255  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.54 
 
 
632 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23831  cell division protein FtsH2  38.05 
 
 
615 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0657792 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.23 
 
 
638 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.2 
 
 
666 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.2 
 
 
666 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.2 
 
 
852 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0357  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.81 
 
 
613 aa  122  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0125367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  39.8 
 
 
387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.44 
 
 
635 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1852  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.24 
 
 
612 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3612  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.73 
 
 
628 aa  122  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  37.07 
 
 
619 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  37.07 
 
 
617 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  35.37 
 
 
613 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.47 
 
 
640 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2043  peptidase M41, FtsH  38.05 
 
 
617 aa  121  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0301  FtsH peptidase  38.05 
 
 
616 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0690  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.65 
 
 
631 aa  121  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.827702  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  37.07 
 
 
617 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0348  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 
812 aa  121  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.845111  normal  0.923404 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.5 
 
 
610 aa  120  3e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.68 
 
 
643 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 
628 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  35.06 
 
 
651 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 
628 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.1 
 
 
617 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.65 
 
 
637 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698046  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.48 
 
 
640 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  35.5 
 
 
611 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.89 
 
 
640 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.49 
 
 
634 aa  120  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.95 
 
 
647 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_002978  WD1253  cell division protein FtsH  32.49 
 
 
613 aa  120  6e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  36.02 
 
 
640 aa  120  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5220  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.14 
 
 
631 aa  120  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.73 
 
 
635 aa  120  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  35.07 
 
 
652 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.05 
 
 
714 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1595  cell division protein FtsH2  37.56 
 
 
615 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.169685  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.05 
 
 
696 aa  120  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.61 
 
 
655 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  34.7 
 
 
646 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  36.59 
 
 
617 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  35.37 
 
 
613 aa  119  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.78 
 
 
645 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.89 
 
 
667 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  32.05 
 
 
628 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.27 
 
 
640 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  35.78 
 
 
644 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  34.04 
 
 
635 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  33.92 
 
 
628 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.2 
 
 
660 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  35.61 
 
 
617 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.37 
 
 
612 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  36.32 
 
 
646 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.82 
 
 
666 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.1 
 
 
651 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.71 
 
 
666 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.61 
 
 
643 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.71 
 
 
662 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.91 
 
 
633 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.15 
 
 
645 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  33.82 
 
 
637 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.95 
 
 
627 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0276  ATP-dependent Zn protease  33.91 
 
 
708 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00629107  normal  0.162688 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.71 
 
 
666 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.94 
 
 
732 aa  117  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>