More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0674 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_34520  AAA+ family ATPase  57.05 
 
 
747 aa  731    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0185945  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0155  vesicle-fusing ATPase  65.94 
 
 
729 aa  862    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10440  ATPase  65.8 
 
 
728 aa  837    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3711  Adenosinetriphosphatase  64.5 
 
 
733 aa  852    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0583  vesicle-fusing ATPase  66.17 
 
 
741 aa  880    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0674  Adenosinetriphosphatase  100 
 
 
737 aa  1392    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.444846  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0432  Microtubule-severing ATPase  57.41 
 
 
734 aa  707    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0369558  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0592  vesicle-fusing ATPase  66.03 
 
 
741 aa  879    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524368  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0293  microtubule-severing ATPase  53.37 
 
 
748 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.48554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0749  vesicle-fusing ATPase  65.72 
 
 
742 aa  862    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64662  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0605  vesicle-fusing ATPase  66.03 
 
 
741 aa  879    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0436  Adenosinetriphosphatase  48.88 
 
 
749 aa  604  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.544283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0254  microtubule-severing ATPase  51.46 
 
 
750 aa  598  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.62 
 
 
732 aa  391  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.45 
 
 
768 aa  370  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.58 
 
 
718 aa  371  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.64 
 
 
739 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.42 
 
 
731 aa  362  1e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.19 
 
 
731 aa  360  4e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.51 
 
 
735 aa  360  5e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.29 
 
 
731 aa  359  9.999999999999999e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.66 
 
 
731 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.19 
 
 
759 aa  353  7e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.94 
 
 
760 aa  353  8e-96  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.97 
 
 
727 aa  352  1e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.63 
 
 
719 aa  350  6e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.91 
 
 
721 aa  349  1e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.05 
 
 
723 aa  348  2e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  31.28 
 
 
775 aa  347  4e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.74 
 
 
701 aa  345  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  30.45 
 
 
754 aa  342  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.98 
 
 
740 aa  343  1e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.06 
 
 
743 aa  342  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.69 
 
 
757 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.71 
 
 
738 aa  340  8e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.38 
 
 
736 aa  339  9.999999999999999e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.18 
 
 
769 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.27 
 
 
740 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.32 
 
 
742 aa  338  1.9999999999999998e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.45 
 
 
781 aa  335  2e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.49 
 
 
742 aa  335  2e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.69 
 
 
773 aa  335  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.31 
 
 
756 aa  335  3e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.59 
 
 
755 aa  333  8e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.85 
 
 
781 aa  332  2e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.06 
 
 
738 aa  330  6e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.57 
 
 
808 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.65 
 
 
757 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.1 
 
 
736 aa  327  6e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.65 
 
 
757 aa  326  9e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.07 
 
 
737 aa  325  2e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.57 
 
 
738 aa  325  2e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.63 
 
 
754 aa  324  3e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.73 
 
 
737 aa  323  5e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  30.86 
 
 
810 aa  324  5e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  33.43 
 
 
732 aa  323  6e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  32.5 
 
 
764 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.33 
 
 
806 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.43 
 
 
715 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.15 
 
 
730 aa  320  7e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.52 
 
 
754 aa  319  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  30.81 
 
 
713 aa  318  3e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.72 
 
 
784 aa  317  5e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.2 
 
 
754 aa  317  6e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.15 
 
 
704 aa  316  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  34.82 
 
 
739 aa  316  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  37.66 
 
 
803 aa  316  9.999999999999999e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  30.62 
 
 
763 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  40.78 
 
 
703 aa  313  9e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  32.78 
 
 
718 aa  312  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.89 
 
 
772 aa  311  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.51 
 
 
801 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  33.46 
 
 
703 aa  310  6.999999999999999e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.19 
 
 
805 aa  307  4.0000000000000004e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.5 
 
 
754 aa  307  5.0000000000000004e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.83 
 
 
852 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36182  predicted protein  39.27 
 
 
567 aa  305  3.0000000000000004e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  34.83 
 
 
788 aa  301  3e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  37.63 
 
 
810 aa  301  3e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.53 
 
 
805 aa  300  7e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  35.11 
 
 
776 aa  300  9e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  33.76 
 
 
722 aa  299  1e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  32.93 
 
 
746 aa  298  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  34.17 
 
 
699 aa  298  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  36.1 
 
 
550 aa  298  3e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  29.43 
 
 
721 aa  296  7e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.37 
 
 
763 aa  296  9e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  36.67 
 
 
829 aa  296  1e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  38.9 
 
 
613 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  35.73 
 
 
691 aa  294  5e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.39 
 
 
801 aa  293  8e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  30.39 
 
 
826 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  29.1 
 
 
804 aa  290  7e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  33.71 
 
 
810 aa  289  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.48 
 
 
753 aa  288  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  36.75 
 
 
601 aa  287  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.34 
 
 
804 aa  286  9e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  33.58 
 
 
685 aa  283  8.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  34.4 
 
 
814 aa  282  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  34.2 
 
 
806 aa  283  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>