164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3701 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3701  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 447 aa  908    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  unclonable  0.0000000375637  normal  0.401469 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1413  extracellular solute-binding protein family 1  48.72 
 
 		 411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127019  normal  0.973051 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4286  extracellular solute-binding protein  39.32 
 
 		 415 aa  302  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.683579  normal  0.881811 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4092  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518601  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.23 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2064  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  29.07 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 498 aa  67  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.98 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.98 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.98 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2539  putative ABC transporter, substrate binding protein  24.38 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  27.39 
 
 		 447 aa  53.5  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 363 aa  53.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.95 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2796  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 		 468 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3854  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03697  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.5 
 
 		 675 aa  52.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  36.76 
 
 		 458 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 435 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.24 
 
 		 326 aa  51.2  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 413 aa  51.2  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 		 449 aa  50.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25 
 
 		 421 aa  50.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.23 
 
 		 443 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 478 aa  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 410 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 436 aa  49.7  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5309  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574903  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  23.41 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 439 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3144  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.56 
 
 		 460 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  24.85 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  26.36 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0080  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.68 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  33.8 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2977  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.576527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 423 aa  48.5  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  34.85 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 432 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 445 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  20.06 
 
 		 437 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 432 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  36.36 
 
 		 437 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  31.82 
 
 		 440 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 466 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 		 413 aa  47  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0083  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 429 aa  47  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0883  twin-arginine translocation pathway signal  20.34 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>