More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0156 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0156  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  100 
 
 		 858 aa  1674    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  32.26 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2247  peptidase S1C, Do  30.35 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  30.22 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  30.22 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  30.51 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  32.98 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  36.31 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  36.36 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  33.15 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3642  protease Do  31.46 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.393796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0289  protease Do  32.58 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0319386  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  33.52 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  30.56 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  31.69 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  30.11 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.58 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  32.24 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.46 
 
 		 417 aa  73.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.61 
 
 		 385 aa  74.3  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  31.41 
 
 		 383 aa  73.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.64 
 
 		 408 aa  73.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  32.8 
 
 		 492 aa  73.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  33.94 
 
 		 474 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1306  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.81 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692323  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  32.22 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  34.48 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.94 
 
 		 474 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  30.93 
 
 		 514 aa  72.8  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  30.93 
 
 		 514 aa  73.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  31.61 
 
 		 471 aa  73.2  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.29 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  32.02 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.94 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  32.95 
 
 		 456 aa  72  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  28.18 
 
 		 468 aa  72  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  31.74 
 
 		 458 aa  72  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  31.94 
 
 		 413 aa  72  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  33.33 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  31.28 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  30 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.78 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  33.15 
 
 		 482 aa  71.2  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5469  2-alkenal reductase  27.73 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  hitchhiker  0.001726 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  30.22 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  31.05 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  33.15 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.53 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  31.28 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  31.38 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  35.68 
 
 		 492 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  31.28 
 
 		 457 aa  70.5  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  31.28 
 
 		 457 aa  70.5  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  29.84 
 
 		 501 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  31.28 
 
 		 463 aa  70.5  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  34.48 
 
 		 489 aa  70.5  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  33.15 
 
 		 614 aa  70.5  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  35.68 
 
 		 477 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.87 
 
 		 380 aa  70.5  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3710  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.51 
 
 		 394 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  32.18 
 
 		 485 aa  70.5  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.78 
 
 		 387 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  31.74 
 
 		 457 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  31.67 
 
 		 478 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  30.17 
 
 		 472 aa  70.1  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  31.67 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  30.73 
 
 		 455 aa  69.7  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  33.33 
 
 		 462 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  31.52 
 
 		 372 aa  69.7  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  30.73 
 
 		 496 aa  70.1  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  32.8 
 
 		 478 aa  69.7  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  29.95 
 
 		 501 aa  70.1  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  32.2 
 
 		 402 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  31.67 
 
 		 478 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  31.33 
 
 		 524 aa  69.7  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  31.67 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  32.97 
 
 		 446 aa  70.1  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  30.9 
 
 		 477 aa  70.1  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  34.38 
 
 		 475 aa  70.1  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  31.67 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  30.69 
 
 		 449 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1379  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.43 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  32.22 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  33.69 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1229  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 298 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0581563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  31.64 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.64 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  30.17 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  28.8 
 
 		 496 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  34.95 
 
 		 477 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  32.22 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  28.48 
 
 		 518 aa  69.3  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  31.03 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  35.14 
 
 		 479 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  34.36 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  31.07 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  29.94 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  32.58 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0019  protease Do  29.38 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>