More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2926 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0293  riboflavin synthase, alpha subunit  67.84 
 
 		 200 aa  280  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  59.9 
 
 		 194 aa  250  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1926  riboflavin synthase subunit alpha  59.07 
 
 		 195 aa  247  9e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.285487 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  58.88 
 
 		 198 aa  238  2.9999999999999997e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  58.33 
 
 		 194 aa  236  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  54.4 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  58.12 
 
 		 196 aa  229  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0733  riboflavin synthase subunit alpha  57.36 
 
 		 200 aa  218  5e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  45.74 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 		 215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  44.95 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  43.59 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  43.84 
 
 		 208 aa  157  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  39.38 
 
 		 217 aa  156  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  42.86 
 
 		 205 aa  155  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  47.15 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  42.78 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  43.01 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  43.23 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  39.69 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  43.65 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 		 203 aa  148  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  39.59 
 
 		 200 aa  147  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  41.33 
 
 		 217 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  46.75 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  41.33 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  40.41 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  36.04 
 
 		 213 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  44.67 
 
 		 219 aa  142  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  36.79 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  39.58 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  38.27 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  43.37 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 214 aa  141  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  38.66 
 
 		 208 aa  140  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  38.19 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  37.82 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  41.21 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  37.24 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  38.66 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  38.22 
 
 		 205 aa  137  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  38.66 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  37.63 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  39.8 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1857  riboflavin synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1822  riboflavin synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.295003  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  39.58 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  37.37 
 
 		 217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 		 251 aa  135  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  38.73 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  38.12 
 
 		 200 aa  134  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  36.55 
 
 		 216 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  36.22 
 
 		 222 aa  134  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1327  riboflavin synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 210 aa  134  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.254294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1009  riboflavin synthase, alpha subunit  44.85 
 
 		 208 aa  134  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  34.87 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  39.81 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  35.53 
 
 		 220 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  38.97 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  38.34 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  39.47 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  37.88 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  36.68 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  35.03 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  40.31 
 
 		 206 aa  131  5e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  36.79 
 
 		 218 aa  131  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  37.37 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  35.53 
 
 		 223 aa  131  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  40.69 
 
 		 201 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1617  riboflavin synthase subunit alpha  41.15 
 
 		 197 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  37.63 
 
 		 210 aa  130  9e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  35.57 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  35.75 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  35.9 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  35.75 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  37.06 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  35.9 
 
 		 226 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  35.75 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0879  riboflavin synthase subunit alpha  37.17 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888006  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  35.2 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  34.36 
 
 		 216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  37.11 
 
 		 217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  35.75 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>