More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2005 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 218 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  60.83 
 
 		 218 aa  265  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  52.75 
 
 		 215 aa  238  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  54.71 
 
 		 221 aa  234  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  53.92 
 
 		 216 aa  229  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  52.91 
 
 		 223 aa  227  1e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  56.91 
 
 		 187 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  50.92 
 
 		 226 aa  223  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  49.55 
 
 		 214 aa  221  8e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  50.68 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  49.09 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  53.21 
 
 		 207 aa  214  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  52.07 
 
 		 215 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  51.61 
 
 		 214 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  50.92 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  48.64 
 
 		 214 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  49.77 
 
 		 215 aa  211  7.999999999999999e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 217 aa  207  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  48.85 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  49.77 
 
 		 216 aa  205  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  50.46 
 
 		 217 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  50.46 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  48.64 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  48.64 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  49.75 
 
 		 202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  49.5 
 
 		 239 aa  197  9e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  47.73 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  47.73 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  47.73 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  47.73 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  47.73 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  47.73 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  51.28 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  49.32 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  45 
 
 		 222 aa  191  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  45.87 
 
 		 215 aa  188  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  48.99 
 
 		 217 aa  188  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  46.53 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  47.93 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  46.63 
 
 		 203 aa  185  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 		 220 aa  184  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  46.86 
 
 		 204 aa  184  7e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  47.94 
 
 		 211 aa  184  9e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  47.15 
 
 		 202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  47 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  48.45 
 
 		 203 aa  181  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  44.7 
 
 		 211 aa  181  9.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  47.18 
 
 		 216 aa  181  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  45.32 
 
 		 204 aa  181  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  43.18 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  45.27 
 
 		 201 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  49.25 
 
 		 193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  42.53 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  41.36 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  45.83 
 
 		 208 aa  178  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 205 aa  177  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  44.9 
 
 		 200 aa  177  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  46.97 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  45.96 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  41.55 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  41.82 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  41.82 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  41.82 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  41.82 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  40.37 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  44.56 
 
 		 196 aa  175  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  44.75 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  39.55 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  39.45 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  43.67 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  46.91 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  48 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 		 209 aa  171  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  40.64 
 
 		 227 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  41.36 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 223 aa  171  9e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  45.96 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  40.64 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  42.6 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  40.81 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  47.06 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  41.36 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 203 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>