More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1657 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  64.06 
 
 		 220 aa  272  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  61.93 
 
 		 220 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  56.88 
 
 		 220 aa  254  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  57.08 
 
 		 221 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  57.08 
 
 		 221 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  57.08 
 
 		 221 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  58.26 
 
 		 219 aa  253  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  56.42 
 
 		 219 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  56.42 
 
 		 219 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  57.08 
 
 		 221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  56.88 
 
 		 220 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  57.34 
 
 		 220 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  57.99 
 
 		 220 aa  248  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  59.82 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  56.11 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  59.72 
 
 		 221 aa  241  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  58.53 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  58.06 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  58.06 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  58.06 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  52.78 
 
 		 217 aa  238  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  53.24 
 
 		 217 aa  238  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  52.78 
 
 		 217 aa  238  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  57.6 
 
 		 218 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  57.6 
 
 		 218 aa  237  9e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  57.14 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  57.6 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  57.6 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  57.6 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  55.96 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  52.07 
 
 		 218 aa  232  4.0000000000000004e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  56.25 
 
 		 216 aa  231  7.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  55.25 
 
 		 220 aa  228  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  54.55 
 
 		 221 aa  225  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  53.18 
 
 		 221 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  53.24 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  53.24 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  54.87 
 
 		 208 aa  221  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  55.15 
 
 		 200 aa  221  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  52.75 
 
 		 219 aa  221  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  48.65 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  48.65 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  54.17 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  52.97 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  49.09 
 
 		 221 aa  215  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  50.92 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  54.04 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  54.04 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  46.58 
 
 		 220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  48.28 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  56.06 
 
 		 199 aa  207  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  54.87 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 215 aa  204  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 218 aa  204  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2384  riboflavin synthase subunit alpha  51.03 
 
 		 200 aa  201  5e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.599759  normal  0.02171 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  50.46 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  49.08 
 
 		 217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  49.28 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  42.59 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  48.99 
 
 		 208 aa  187  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  51.81 
 
 		 196 aa  187  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  49.05 
 
 		 210 aa  187  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  41.89 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  51.46 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0663  riboflavin synthase subunit alpha  47.89 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0707  riboflavin synthase subunit alpha  47.89 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0752596  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4063  riboflavin synthase subunit alpha  48.29 
 
 		 211 aa  184  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 209 aa  184  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  48.85 
 
 		 215 aa  184  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  50.54 
 
 		 187 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  50.25 
 
 		 204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  48.99 
 
 		 196 aa  182  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  48.47 
 
 		 200 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  49.76 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0620  riboflavin synthase subunit alpha  50.49 
 
 		 204 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  45.78 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  53.61 
 
 		 197 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  44.29 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  44.75 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  52.68 
 
 		 204 aa  181  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 209 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 209 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0301  riboflavin synthase subunit alpha  49.29 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  51.26 
 
 		 197 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  51.53 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1137  riboflavin synthase subunit alpha  49.76 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  51 
 
 		 205 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  44.59 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  50.26 
 
 		 208 aa  179  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  41.47 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>