More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0531 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 217 aa  428  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  99.54 
 
 		 217 aa  424  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  56.48 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  50.46 
 
 		 216 aa  228  8e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  53 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  52.02 
 
 		 223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  52.49 
 
 		 217 aa  218  6e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 215 aa  215  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  49.77 
 
 		 214 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  47.22 
 
 		 216 aa  207  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  53.3 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 215 aa  205  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  48.61 
 
 		 214 aa  204  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 		 214 aa  204  9e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  49.77 
 
 		 226 aa  202  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  50.46 
 
 		 218 aa  201  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 214 aa  201  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  48.42 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  42.4 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  48.39 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 		 214 aa  197  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  44.72 
 
 		 200 aa  197  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  44.95 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 214 aa  194  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  45.6 
 
 		 201 aa  194  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 214 aa  194  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  51.15 
 
 		 207 aa  192  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  50.51 
 
 		 199 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  48.13 
 
 		 187 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  44.29 
 
 		 220 aa  187  9e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  48.47 
 
 		 202 aa  185  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 203 aa  184  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  48.98 
 
 		 193 aa  184  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  45.83 
 
 		 211 aa  184  7e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  47.4 
 
 		 208 aa  184  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  45.45 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  45.24 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  43.06 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  46.76 
 
 		 205 aa  181  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  47.72 
 
 		 215 aa  181  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  44.91 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  47.42 
 
 		 202 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  45.41 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  40.83 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  41.94 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  47 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 217 aa  178  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  43.32 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  41.47 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  47.03 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  42.2 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  41.01 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  45.37 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  42.4 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  41.36 
 
 		 221 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  42.01 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  40.83 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  39.55 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 220 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  46 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  38.99 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  41.67 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  40.27 
 
 		 221 aa  171  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  39.37 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 220 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 218 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 218 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 218 aa  171  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  40.37 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  43.56 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  38.71 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  39.55 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  38.53 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  47.5 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  39.45 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  41.97 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  38.99 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  41.1 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  42.72 
 
 		 204 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  43.69 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  40.64 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  40.64 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  41.01 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>