More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1304 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 
216 aa  437  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  53.09 
 
 
203 aa  202  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04231  riboflavin synthase, alpha subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G06240)  51.67 
 
 
234 aa  194  8.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.126635  normal  0.37448 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06150  riboflavin synthase, putative  53 
 
 
220 aa  192  4e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.630186  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  51.28 
 
 
201 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  51.27 
 
 
203 aa  187  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  52.28 
 
 
204 aa  186  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  47.29 
 
 
205 aa  185  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  48.48 
 
 
199 aa  185  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 
217 aa  184  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 
217 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  51.58 
 
 
215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  46.31 
 
 
205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  47.45 
 
 
217 aa  182  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  46.91 
 
 
215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  48.22 
 
 
217 aa  181  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  47.18 
 
 
218 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 
218 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  50.78 
 
 
208 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  45.36 
 
 
215 aa  179  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  50.26 
 
 
193 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  46.97 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  51.31 
 
 
214 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  52.28 
 
 
205 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 
214 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40556  riboflavin synthase  48.33 
 
 
237 aa  176  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  47.74 
 
 
221 aa  176  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  47.94 
 
 
207 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  49.48 
 
 
216 aa  175  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  48.21 
 
 
221 aa  175  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  47.5 
 
 
200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 
220 aa  171  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 
214 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  47.45 
 
 
223 aa  171  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  45.45 
 
 
239 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38165  predicted protein  47.12 
 
 
232 aa  168  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.891249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 
214 aa  168  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  42.57 
 
 
211 aa  167  8e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 
200 aa  167  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  47.94 
 
 
202 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  46.91 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  48 
 
 
227 aa  165  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  46.43 
 
 
200 aa  165  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  44.93 
 
 
205 aa  165  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  44.62 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  44.22 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  44.88 
 
 
223 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  48.77 
 
 
187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  48.73 
 
 
215 aa  162  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  48.24 
 
 
201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  44.78 
 
 
219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  47.06 
 
 
203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  47.06 
 
 
203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  42.57 
 
 
210 aa  161  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  44.79 
 
 
197 aa  161  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  44.28 
 
 
219 aa  161  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  44.1 
 
 
226 aa  161  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  46.57 
 
 
203 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 
219 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  44.12 
 
 
217 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  43.43 
 
 
196 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  47.96 
 
 
205 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  46.57 
 
 
205 aa  160  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 
220 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  45.96 
 
 
220 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  48.7 
 
 
212 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  45.31 
 
 
215 aa  159  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  45.45 
 
 
218 aa  159  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  47.26 
 
 
204 aa  159  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  45.45 
 
 
218 aa  159  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  45.27 
 
 
217 aa  158  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 
214 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 
214 aa  158  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 
214 aa  158  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 
214 aa  158  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  43.08 
 
 
205 aa  158  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 
214 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  46.91 
 
 
214 aa  158  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 
217 aa  157  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 
232 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 
207 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 
221 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 
221 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 
221 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 
208 aa  156  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  43.08 
 
 
208 aa  156  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  44.56 
 
 
202 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  47.18 
 
 
202 aa  156  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  44.1 
 
 
200 aa  156  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  44.33 
 
 
214 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 
221 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 
220 aa  155  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  43.3 
 
 
199 aa  155  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 
201 aa  155  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 
214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 
196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 
214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  42.78 
 
 
216 aa  155  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>