More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1866 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 205 aa  408  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  44.93 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  46.67 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  45.85 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  45.24 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  45.67 
 
 		 200 aa  161  7e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 205 aa  160  9e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  45.97 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  49.76 
 
 		 199 aa  159  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  48.33 
 
 		 226 aa  158  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  45.22 
 
 		 238 aa  158  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  47.06 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  45.15 
 
 		 219 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  43.9 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  46.58 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  44.66 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  45.15 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  49.75 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  43.96 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  43.96 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  40.38 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  43.96 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  47.06 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  43.96 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  47.34 
 
 		 202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 193 aa  154  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  41.26 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  47.17 
 
 		 217 aa  154  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  44.71 
 
 		 220 aa  154  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  43.96 
 
 		 218 aa  154  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 200 aa  154  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  41.95 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  43.96 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  46.19 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  43.96 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  43.14 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  45.63 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  45.1 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  46.12 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  48.1 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  43.2 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  53.76 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  43.07 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  44.81 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  43 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  43.26 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 221 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  48.06 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 221 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 221 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  44.61 
 
 		 220 aa  151  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  44.93 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  45.15 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  43.63 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  45.81 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  48.04 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  39.71 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 220 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  39.71 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  47.29 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  46.83 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  46.31 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2946  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  42.31 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  46.31 
 
 		 203 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  46.31 
 
 		 203 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  43.75 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  48.08 
 
 		 203 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  46.89 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 221 aa  148  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  42.51 
 
 		 199 aa  148  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 221 aa  147  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  47.62 
 
 		 204 aa  148  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  43.27 
 
 		 196 aa  147  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  40.29 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3109  riboflavin synthase subunit alpha  42.45 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  47.14 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  48.08 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  42.93 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  44.88 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  40.78 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  44.93 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  46.45 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  45.59 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>