More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2996 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 202 aa  394  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  74.61 
 
 		 199 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  71.35 
 
 		 202 aa  271  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  69.54 
 
 		 223 aa  268  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  65.48 
 
 		 203 aa  247  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  63.54 
 
 		 193 aa  238  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  65.28 
 
 		 221 aa  238  5.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  63.82 
 
 		 205 aa  237  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  63.5 
 
 		 204 aa  237  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  63.4 
 
 		 208 aa  236  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  63 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  64.8 
 
 		 201 aa  234  9e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  62.07 
 
 		 220 aa  232  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  65.84 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  60.2 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  64.18 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  61.54 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  60.29 
 
 		 215 aa  227  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  61.5 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  62.31 
 
 		 203 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  62.31 
 
 		 203 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  61.81 
 
 		 203 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  59.28 
 
 		 227 aa  221  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  56.14 
 
 		 238 aa  218  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  60.87 
 
 		 208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  59.8 
 
 		 200 aa  210  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  53.23 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  60.61 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  58.38 
 
 		 196 aa  201  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  56.65 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  53.96 
 
 		 215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  58.85 
 
 		 214 aa  197  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  47.76 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  53.65 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  48.24 
 
 		 226 aa  194  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  49.48 
 
 		 215 aa  194  6e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  53.54 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  53.92 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  47.45 
 
 		 207 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  49.49 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  54.37 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  53.12 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  53.96 
 
 		 222 aa  188  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  52.71 
 
 		 217 aa  187  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  51.24 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  48.47 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  48.98 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  48.98 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  53.89 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  48.47 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  44.67 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  48.98 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  50.5 
 
 		 227 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  43.23 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 		 251 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 214 aa  181  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  56.57 
 
 		 202 aa  181  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  49.21 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  48.77 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  47.06 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  48.19 
 
 		 221 aa  177  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  48.72 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  48.72 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  48.96 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  51.3 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  48.79 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  48.7 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  48.45 
 
 		 192 aa  175  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  48.19 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  45.83 
 
 		 222 aa  174  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  47.29 
 
 		 219 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  54.49 
 
 		 187 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  47.78 
 
 		 219 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  48.96 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  48.51 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  45.77 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  49.01 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  48.19 
 
 		 213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  48.44 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 220 aa  171  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  51.3 
 
 		 199 aa  171  9e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  49.22 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  48.28 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  45.69 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  45.15 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  45.41 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>