More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1859 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 
204 aa  394  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  66.83 
 
 
200 aa  239  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  67.01 
 
 
199 aa  234  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  63.51 
 
 
223 aa  234  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  64.65 
 
 
205 aa  229  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  63.96 
 
 
221 aa  221  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  60.87 
 
 
201 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  64.32 
 
 
214 aa  217  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  61.95 
 
 
203 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  62.56 
 
 
209 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  62.63 
 
 
203 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  63.13 
 
 
205 aa  216  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  61.95 
 
 
203 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  63.96 
 
 
220 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  61.46 
 
 
203 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  60.61 
 
 
202 aa  209  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  59.22 
 
 
204 aa  209  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  59.8 
 
 
217 aa  208  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  59.13 
 
 
210 aa  208  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  60.19 
 
 
207 aa  208  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  57.43 
 
 
202 aa  208  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  64.53 
 
 
212 aa  204  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  59.2 
 
 
215 aa  203  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  59.42 
 
 
208 aa  202  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  53 
 
 
193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  57.79 
 
 
208 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  61.42 
 
 
202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  56.25 
 
 
226 aa  191  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  52.28 
 
 
216 aa  186  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  56.31 
 
 
222 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  46.97 
 
 
218 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  54.59 
 
 
233 aa  185  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  52.68 
 
 
227 aa  184  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  46 
 
 
215 aa  184  7e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  53.54 
 
 
220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  53.81 
 
 
215 aa  182  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  52.68 
 
 
219 aa  181  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  54.95 
 
 
221 aa  181  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  53.54 
 
 
219 aa  180  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  51.52 
 
 
221 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  51.52 
 
 
221 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  51.52 
 
 
221 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 
216 aa  179  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  50.5 
 
 
223 aa  179  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  48.24 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  52.53 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  51.52 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  46.04 
 
 
207 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
221 aa  177  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  52.02 
 
 
220 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  51.52 
 
 
219 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  52.02 
 
 
219 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  53.03 
 
 
220 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  51.01 
 
 
220 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  54.5 
 
 
196 aa  174  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  52.02 
 
 
216 aa  174  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  53.54 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  48.92 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  53 
 
 
204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  51.01 
 
 
220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 
217 aa  170  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  53.81 
 
 
215 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 
217 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  43.43 
 
 
217 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 
217 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 
217 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  46.7 
 
 
217 aa  168  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  57.32 
 
 
211 aa  168  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  50.76 
 
 
203 aa  168  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  47.29 
 
 
217 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  51.47 
 
 
199 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 
214 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  44.67 
 
 
218 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  44.16 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  52.76 
 
 
201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  52.38 
 
 
218 aa  165  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  52.2 
 
 
251 aa  165  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  52.22 
 
 
215 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  47.76 
 
 
214 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  45 
 
 
220 aa  165  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  48.73 
 
 
213 aa  165  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  44.16 
 
 
216 aa  164  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  51.47 
 
 
209 aa  164  9e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  44.78 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  48.5 
 
 
221 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 
203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  51.72 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  48.5 
 
 
217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  45.69 
 
 
215 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  51.72 
 
 
215 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 
215 aa  161  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  44.28 
 
 
239 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 
223 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  41.12 
 
 
214 aa  159  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  48.22 
 
 
200 aa  159  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1534  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 
201 aa  159  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00190054  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  50.51 
 
 
199 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 
223 aa  158  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  44.55 
 
 
223 aa  158  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 
213 aa  158  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>