More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1868 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 216 aa  440  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  63.78 
 
 		 220 aa  259  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  58.6 
 
 		 220 aa  251  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  61.73 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  61.73 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  61.73 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  61.73 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  58.14 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  58.14 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  60.71 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  60.71 
 
 		 220 aa  245  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  53.5 
 
 		 218 aa  234  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  58.76 
 
 		 218 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  59.28 
 
 		 221 aa  234  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  55.35 
 
 		 219 aa  234  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  56.8 
 
 		 220 aa  232  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  58.25 
 
 		 218 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  58.25 
 
 		 218 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  57.73 
 
 		 218 aa  231  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  55.45 
 
 		 217 aa  231  6e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  56.25 
 
 		 219 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  54.31 
 
 		 217 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  53 
 
 		 217 aa  231  9e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  55.61 
 
 		 220 aa  231  9e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  58.38 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  58.76 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  57.73 
 
 		 218 aa  229  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  55.61 
 
 		 221 aa  230  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  57.22 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  57.22 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  57.22 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  57.22 
 
 		 218 aa  228  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  50.74 
 
 		 217 aa  227  8e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  55.56 
 
 		 221 aa  227  9e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  53.96 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  51.47 
 
 		 220 aa  225  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  51.92 
 
 		 220 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  55.56 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  54.36 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  54.36 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  53.14 
 
 		 208 aa  218  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  52.82 
 
 		 218 aa  214  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  52.82 
 
 		 218 aa  214  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  55.15 
 
 		 200 aa  213  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  50.48 
 
 		 220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  54.64 
 
 		 200 aa  207  7e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  54.64 
 
 		 200 aa  207  9e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  52.94 
 
 		 218 aa  205  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  46.36 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2384  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.599759  normal  0.02171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  54.92 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  52.28 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  51.28 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  51.28 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  50.26 
 
 		 201 aa  192  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  49.48 
 
 		 219 aa  191  8e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  51.03 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  51.79 
 
 		 216 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  48.34 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  46.89 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0707  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0752596  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  46.39 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0663  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 196 aa  180  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  47.06 
 
 		 202 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3100  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 204 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  47.29 
 
 		 209 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  48.48 
 
 		 193 aa  177  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  47.29 
 
 		 209 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  47.29 
 
 		 209 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  42.78 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  48.7 
 
 		 196 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  47.29 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  47.29 
 
 		 209 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  48.5 
 
 		 215 aa  174  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  46.04 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  44.16 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  48 
 
 		 211 aa  174  9e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  45.93 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2014  riboflavin synthase subunit alpha  47.26 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3066  riboflavin synthase subunit alpha  47.26 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2144  riboflavin synthase subunit alpha  47.26 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2599  riboflavin synthase subunit alpha  47.26 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3101  riboflavin synthase subunit alpha  47.26 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2527  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.670524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3013  riboflavin synthase subunit alpha  47.26 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  44.22 
 
 		 226 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0766  riboflavin synthase subunit alpha  47.26 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1541  riboflavin synthase subunit alpha  46.8 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0894  riboflavin synthase subunit alpha  46.8 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  45.93 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>