More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1750 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 213 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  60.56 
 
 		 213 aa  256  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  55.76 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  55.56 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  52.09 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  56.35 
 
 		 223 aa  216  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 214 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  48.15 
 
 		 216 aa  208  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 216 aa  204  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  45.25 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  51.03 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  48.36 
 
 		 214 aa  194  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  53.61 
 
 		 199 aa  191  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  53.12 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  45.79 
 
 		 215 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  47.71 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  48.83 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  48.13 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  45 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  51.55 
 
 		 215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  49.22 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  44.65 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  43.98 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  44.5 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  45.62 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  49.75 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  43.58 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  48.06 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  48.76 
 
 		 204 aa  179  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  51.5 
 
 		 200 aa  179  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  45.33 
 
 		 207 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  44.09 
 
 		 221 aa  177  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  44.09 
 
 		 221 aa  177  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  44.09 
 
 		 221 aa  177  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  42.4 
 
 		 217 aa  178  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  44.09 
 
 		 221 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  44.7 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  42.4 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  48.13 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  43.3 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  45.69 
 
 		 239 aa  175  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  43.58 
 
 		 219 aa  175  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  42.4 
 
 		 218 aa  174  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  40.64 
 
 		 220 aa  174  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  40.19 
 
 		 214 aa  174  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 217 aa  174  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  40.65 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  41.67 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  45.18 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  47.96 
 
 		 208 aa  173  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  44.91 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  45.98 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  39.72 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  42.73 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  48.77 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  48.72 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  41.59 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  43.12 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  46.34 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  49 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  42.73 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  41.47 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  42.41 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1534  riboflavin synthase subunit alpha  45.92 
 
 		 201 aa  168  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00190054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  46.08 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  41.82 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  48.19 
 
 		 198 aa  167  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 220 aa  167  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  43.94 
 
 		 216 aa  167  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  40.69 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  47.18 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  41.12 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  47.45 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0879  riboflavin synthase subunit alpha  45.03 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>