More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1620 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 224 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  60.71 
 
 		 224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  59.13 
 
 		 230 aa  269  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  60.54 
 
 		 220 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  60.27 
 
 		 218 aa  263  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  56.5 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  47.14 
 
 		 220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  46.88 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  44.2 
 
 		 217 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  43.11 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  43.3 
 
 		 214 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  45.33 
 
 		 216 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  44.2 
 
 		 213 aa  175  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  42.41 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  42.41 
 
 		 213 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  40.81 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  47.18 
 
 		 196 aa  162  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  38.05 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  46.97 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  38.94 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  39.56 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  39.11 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  39.11 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  39.11 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  41.96 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  37.22 
 
 		 217 aa  158  8e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  39.11 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  39.65 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  43.75 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  39.56 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  41.07 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  40.44 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  40.81 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  39.11 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  38.22 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  38.22 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  39.11 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 		 215 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  39.11 
 
 		 220 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  43.59 
 
 		 203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  37.78 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  37.78 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  38.22 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  39.49 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  38.22 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  36.77 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  45.67 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  37.78 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  43.81 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  36.16 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 220 aa  148  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  42.86 
 
 		 227 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  41.33 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 196 aa  147  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  42.15 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  42.49 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  42.58 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  37.11 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  35.71 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  37.78 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  44 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  38.39 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  42.56 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 197 aa  144  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  41.29 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  38.94 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  38.83 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1416  riboflavin synthase subunit alpha  36.56 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  41.92 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  40.82 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  41.79 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  35.56 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>