More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2435 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 224 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  69.64 
 
 		 220 aa  322  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  66.07 
 
 		 218 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  65.38 
 
 		 230 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  64.89 
 
 		 220 aa  287  7e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  60.71 
 
 		 224 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  48.23 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  46.22 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  42.41 
 
 		 213 aa  178  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  43.56 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  44.93 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  44.64 
 
 		 216 aa  175  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  45.58 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  42.41 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  43.11 
 
 		 216 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  39.29 
 
 		 217 aa  167  9e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  47.94 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  44.06 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 196 aa  165  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  38.39 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 		 201 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  38.39 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  42.48 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  42.48 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  45.5 
 
 		 204 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  38.39 
 
 		 217 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  38.39 
 
 		 217 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  46.57 
 
 		 208 aa  161  9e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  43.12 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  41.07 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  38.67 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  42.67 
 
 		 227 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  43.23 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  39.73 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  39.11 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  45.18 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  40.71 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  44.27 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  44.27 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  40.97 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  38.84 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  40.35 
 
 		 223 aa  158  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  46.63 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  45.05 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  45.36 
 
 		 200 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  43.81 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  41 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  40.27 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 226 aa  155  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  39.29 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 203 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 203 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 203 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  40.71 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  38.94 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  43.88 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  45.18 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  38.22 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  38.94 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  36 
 
 		 217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 208 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  44.16 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  38.22 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  36.44 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  44.66 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  41.71 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2662  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0632112  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  44 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  38.22 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  38.67 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  39.06 
 
 		 239 aa  149  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  37.95 
 
 		 215 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  37.78 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 197 aa  148  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  38.67 
 
 		 219 aa  148  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  38.22 
 
 		 217 aa  148  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  38.94 
 
 		 221 aa  147  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  38.67 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  38.22 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  37.33 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  37.33 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  37.33 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>