More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04399 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  80.93 
 
 		 208 aa  330  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  78.06 
 
 		 200 aa  309  2e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  78.06 
 
 		 200 aa  309  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  57.73 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  55.15 
 
 		 219 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  52.58 
 
 		 221 aa  214  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  55.15 
 
 		 216 aa  213  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  56 
 
 		 221 aa  212  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  55.15 
 
 		 220 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  56.19 
 
 		 227 aa  211  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  55.15 
 
 		 220 aa  210  9e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  54.12 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  54.12 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  54.12 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  54.12 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  54.08 
 
 		 218 aa  207  8e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  54.08 
 
 		 218 aa  207  8e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  53.09 
 
 		 220 aa  205  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  53.61 
 
 		 219 aa  204  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  53.09 
 
 		 220 aa  203  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  53.09 
 
 		 219 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  52.06 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  53.09 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  51.55 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 217 aa  194  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  48.45 
 
 		 220 aa  194  8.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  48.51 
 
 		 223 aa  193  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  52.58 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 218 aa  192  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 217 aa  191  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 218 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 218 aa  191  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  49.49 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  52.58 
 
 		 199 aa  191  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 218 aa  191  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  48.47 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  48.99 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  47.94 
 
 		 218 aa  188  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  49.48 
 
 		 221 aa  188  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2384  riboflavin synthase subunit alpha  49.48 
 
 		 200 aa  187  7e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.599759  normal  0.02171 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  51.81 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  47.94 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 221 aa  184  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  49.74 
 
 		 196 aa  184  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  48.45 
 
 		 221 aa  184  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  47.94 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  43.33 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  45.69 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  50.76 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2946  riboflavin synthase subunit alpha  51.21 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  42.78 
 
 		 218 aa  178  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  49.48 
 
 		 219 aa  177  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  47.94 
 
 		 216 aa  176  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  47.18 
 
 		 200 aa  176  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  46.91 
 
 		 208 aa  175  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 216 aa  174  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  50.5 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  49.76 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3100  riboflavin synthase subunit alpha  49.01 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  42.78 
 
 		 217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  46.04 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  46.34 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  49.22 
 
 		 196 aa  171  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  46.57 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  49.23 
 
 		 196 aa  170  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2916  riboflavin synthase subunit alpha  48.11 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0248627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  44.72 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  46.7 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  47.76 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  42.56 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  47.18 
 
 		 217 aa  168  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0714  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.854328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  43.94 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  48.48 
 
 		 202 aa  168  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0894  riboflavin synthase subunit alpha  48.77 
 
 		 204 aa  168  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0620  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 204 aa  167  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  47.72 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  46 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3109  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  45.92 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2014  riboflavin synthase subunit alpha  47.76 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2144  riboflavin synthase subunit alpha  47.76 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0766  riboflavin synthase subunit alpha  47.76 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3013  riboflavin synthase subunit alpha  47.76 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3101  riboflavin synthase subunit alpha  47.76 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1541  riboflavin synthase subunit alpha  46.34 
 
 		 209 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2599  riboflavin synthase subunit alpha  47.76 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3066  riboflavin synthase subunit alpha  47.76 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2667  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>