More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2916 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2916  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 219 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0248627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2884  riboflavin synthase subunit alpha  81.52 
 
 		 214 aa  346  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.95813  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2667  riboflavin synthase subunit alpha  74.53 
 
 		 214 aa  317  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3109  riboflavin synthase subunit alpha  74.29 
 
 		 237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2946  riboflavin synthase subunit alpha  69.23 
 
 		 205 aa  287  8e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3100  riboflavin synthase subunit alpha  62.2 
 
 		 204 aa  249  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  61.61 
 
 		 209 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  61.61 
 
 		 209 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  61.61 
 
 		 209 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  63.03 
 
 		 209 aa  248  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  63.03 
 
 		 209 aa  248  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0620  riboflavin synthase subunit alpha  62.2 
 
 		 204 aa  247  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0271  riboflavin synthase subunit alpha  60.56 
 
 		 205 aa  247  9e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.800098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0894  riboflavin synthase subunit alpha  61.24 
 
 		 204 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4063  riboflavin synthase subunit alpha  59.81 
 
 		 211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  62.02 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1541  riboflavin synthase subunit alpha  60.66 
 
 		 209 aa  242  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0663  riboflavin synthase subunit alpha  59.45 
 
 		 217 aa  242  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0707  riboflavin synthase subunit alpha  59.45 
 
 		 217 aa  242  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0752596  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0766  riboflavin synthase subunit alpha  61.84 
 
 		 204 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2014  riboflavin synthase subunit alpha  61.84 
 
 		 204 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2144  riboflavin synthase subunit alpha  61.84 
 
 		 204 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2599  riboflavin synthase subunit alpha  61.84 
 
 		 204 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3101  riboflavin synthase subunit alpha  61.84 
 
 		 204 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3013  riboflavin synthase subunit alpha  61.84 
 
 		 204 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3066  riboflavin synthase subunit alpha  61.84 
 
 		 204 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  61.61 
 
 		 210 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  58.77 
 
 		 209 aa  231  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0299  riboflavin synthase subunit alpha  60.09 
 
 		 204 aa  230  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.931154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0714  riboflavin synthase subunit alpha  58.17 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.854328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  53.11 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  50.96 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  53.02 
 
 		 199 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  52.38 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  50.24 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  46.79 
 
 		 220 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  44.6 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  48.11 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  47.62 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  43.58 
 
 		 221 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  46.33 
 
 		 227 aa  167  8e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  43.58 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  43.58 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  43.58 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  44.34 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  43.89 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  46.67 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  44.14 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  43.58 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 		 221 aa  161  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  43.46 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  44.29 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  43.58 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  43.81 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  45.33 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  43.19 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  46.3 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  46.3 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  42.99 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  44.86 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  41.9 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  44.81 
 
 		 207 aa  155  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  44.91 
 
 		 204 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 		 217 aa  154  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  43.87 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  42.86 
 
 		 196 aa  154  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  42.52 
 
 		 223 aa  154  9e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  44.76 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  40.91 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  43.13 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  47.17 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  43.6 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  42.18 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  47.17 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  44.08 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  43.87 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  41.78 
 
 		 199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  44.19 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  44.08 
 
 		 196 aa  151  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  42.59 
 
 		 200 aa  151  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  43.13 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  41.12 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  45.28 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  40.76 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  45.37 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2384  riboflavin synthase subunit alpha  43.81 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.599759  normal  0.02171 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  42.45 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  42.45 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  42.45 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  42.45 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0301  riboflavin synthase subunit alpha  43.81 
 
 		 214 aa  149  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  42.45 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>