More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3463 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  395  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0301  riboflavin synthase subunit alpha  53.59 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  57.29 
 
 		 209 aa  205  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 		 215 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  46.19 
 
 		 217 aa  191  8e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  47.45 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  54.12 
 
 		 216 aa  184  9e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 221 aa  178  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 215 aa  177  7e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 214 aa  176  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  50.75 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 214 aa  175  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  44.67 
 
 		 216 aa  174  6e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  51.98 
 
 		 217 aa  174  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  46.27 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  49.22 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  49.22 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  44.88 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  46.91 
 
 		 196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2883  riboflavin synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 215 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.34702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  45.41 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  49.49 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 218 aa  169  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  45.92 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  50.52 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 220 aa  167  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 216 aa  167  9e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  46.94 
 
 		 217 aa  167  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  46.94 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  51.47 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 		 219 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  45.36 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  47.96 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  42.93 
 
 		 217 aa  165  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  48.47 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  43.65 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 209 aa  165  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  48.24 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  47.69 
 
 		 202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  47.98 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  48.21 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  43.88 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  44.62 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  46.63 
 
 		 218 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 226 aa  162  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  48.19 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  47.67 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  44.1 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  48.68 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 		 217 aa  161  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  44.5 
 
 		 202 aa  161  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3109  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  52.33 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  43.81 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  46.39 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  44.22 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  41.41 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  40.31 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  43.9 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  46.88 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  50.51 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  43.3 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  48 
 
 		 210 aa  158  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 199 aa  158  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2946  riboflavin synthase subunit alpha  46.6 
 
 		 205 aa  158  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  41.12 
 
 		 239 aa  158  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  44.56 
 
 		 213 aa  157  7e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 220 aa  157  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 198 aa  157  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3167  riboflavin synthase, alpha subunit  44.76 
 
 		 212 aa  157  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3362  riboflavin synthase, alpha subunit  44.08 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  42.78 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>