More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2063 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  47.87 
 
 		 196 aa  188  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  49.74 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  49.21 
 
 		 218 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  45.74 
 
 		 197 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  50.79 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  49.28 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  50.5 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  49.21 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  47.87 
 
 		 201 aa  171  6.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  46.28 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1926  riboflavin synthase subunit alpha  43.32 
 
 		 195 aa  170  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.285487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  48.95 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  45.74 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  48.69 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  43 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  49.74 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 		 215 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  48.68 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  43.15 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  47.64 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  46.91 
 
 		 202 aa  165  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2883  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.34702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  41.95 
 
 		 217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  45.21 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  41.95 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 218 aa  160  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  42.02 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  45.79 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  45.5 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  44.67 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  43.62 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0293  riboflavin synthase, alpha subunit  43.23 
 
 		 200 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  46.73 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  42.71 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  46.88 
 
 		 201 aa  155  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  46.88 
 
 		 216 aa  154  7e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 220 aa  154  7e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  46.19 
 
 		 204 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  47.89 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  45.64 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  47.37 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  41.79 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  45.18 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  42.42 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  44.97 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  42.42 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  46.27 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  44.9 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  44.28 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  47.62 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  43.39 
 
 		 192 aa  151  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  42.33 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  45.36 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  43.52 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  44.56 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1009  riboflavin synthase, alpha subunit  48.77 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  43.39 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  43.88 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_002950  PG0733  riboflavin synthase subunit alpha  40.7 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0239  riboflavin synthase subunit alpha  39.06 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  45.5 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  44.16 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  44 
 
 		 208 aa  147  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  43.28 
 
 		 217 aa  147  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1617  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 197 aa  147  8e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  43.09 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  45.03 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  41.75 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  46.32 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  42.11 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  39.68 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  42.63 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  44.21 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  42.47 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 214 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 214 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 214 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 214 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 214 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  40.74 
 
 		 214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  40.74 
 
 		 214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  42.33 
 
 		 213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>