More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18150 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 
200 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  66.83 
 
 
204 aa  239  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  62.31 
 
 
202 aa  232  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  64.8 
 
 
199 aa  228  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  60.5 
 
 
205 aa  226  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  64.14 
 
 
214 aa  224  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  60.78 
 
 
204 aa  222  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  62.19 
 
 
203 aa  220  9e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  60.91 
 
 
221 aa  219  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  64.29 
 
 
212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  61.5 
 
 
210 aa  218  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  59.51 
 
 
207 aa  216  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  61.69 
 
 
201 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  62.69 
 
 
209 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  62.12 
 
 
205 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  59.13 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  58.79 
 
 
220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  59.8 
 
 
202 aa  210  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  59.02 
 
 
217 aa  210  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  60.71 
 
 
208 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  58.42 
 
 
203 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  58.42 
 
 
203 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  57.92 
 
 
203 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  61.81 
 
 
202 aa  205  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  58.42 
 
 
223 aa  204  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  58.5 
 
 
215 aa  204  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  52 
 
 
193 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  53.81 
 
 
227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  53.4 
 
 
233 aa  191  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  46.77 
 
 
215 aa  190  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  56.72 
 
 
215 aa  188  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  53.3 
 
 
220 aa  187  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  49.25 
 
 
216 aa  186  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  51.53 
 
 
238 aa  185  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  48.47 
 
 
217 aa  184  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 
221 aa  184  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  52.2 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  55.1 
 
 
204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
219 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  50.51 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  49.49 
 
 
219 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 
217 aa  181  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  49.25 
 
 
217 aa  181  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  53 
 
 
219 aa  180  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 
214 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  51.5 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  49.25 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  48.76 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  48.21 
 
 
205 aa  178  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  54.5 
 
 
196 aa  178  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 
223 aa  178  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  44.72 
 
 
214 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  52.97 
 
 
227 aa  177  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  48.98 
 
 
221 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  48.98 
 
 
221 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  46.94 
 
 
216 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  46.5 
 
 
215 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  48.98 
 
 
221 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 
218 aa  176  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  47.45 
 
 
204 aa  176  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  48.98 
 
 
221 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
220 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  49.75 
 
 
200 aa  176  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  48.98 
 
 
220 aa  174  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  43.43 
 
 
214 aa  175  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  48.99 
 
 
220 aa  174  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  49.49 
 
 
220 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  46.12 
 
 
220 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  48.47 
 
 
220 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  47.5 
 
 
216 aa  173  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 
214 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  48 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  51.01 
 
 
201 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  48.73 
 
 
219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  52.48 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  48.5 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  48 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  48.24 
 
 
215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  47.24 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  45.92 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  43.56 
 
 
217 aa  171  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  51.02 
 
 
216 aa  171  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  43.56 
 
 
217 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2883  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 
215 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.34702  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  45 
 
 
239 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  48.73 
 
 
218 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  48.73 
 
 
218 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  48.73 
 
 
218 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  45.18 
 
 
216 aa  168  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  43.72 
 
 
207 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  48.22 
 
 
218 aa  167  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2946  riboflavin synthase subunit alpha  49.52 
 
 
205 aa  167  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  50.49 
 
 
251 aa  167  8e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
213 aa  167  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  45.64 
 
 
205 aa  167  9e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 
221 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 
218 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  46.89 
 
 
205 aa  166  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>