More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1254 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 209 aa  406  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  57.29 
 
 		 199 aa  205  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  55.38 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  48.33 
 
 		 217 aa  187  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  50.98 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  50.26 
 
 		 196 aa  185  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  49.48 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  49.49 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  43.54 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  49.74 
 
 		 221 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  51.03 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  52.33 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  50.51 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  48.04 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  44.93 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  48.04 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  48.04 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  44.85 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  48.04 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 220 aa  178  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 218 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 218 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 218 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  48.72 
 
 		 221 aa  177  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 218 aa  177  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 199 aa  177  8e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 219 aa  177  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  43.52 
 
 		 207 aa  177  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  50.51 
 
 		 207 aa  177  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  51.03 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  47.62 
 
 		 218 aa  175  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  47.62 
 
 		 218 aa  175  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  48.72 
 
 		 220 aa  174  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  47.69 
 
 		 216 aa  174  8e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  49.48 
 
 		 220 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  52.45 
 
 		 221 aa  174  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 		 205 aa  171  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  45.18 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 		 218 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  43.37 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  44.85 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  48.73 
 
 		 196 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  51.28 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  50.77 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  47.78 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0632  riboflavin synthase subunit alpha  49.25 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  48.7 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2527  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.670524  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  49.01 
 
 		 202 aa  169  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  47.96 
 
 		 201 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  47.8 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0761  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 202 aa  167  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2384  riboflavin synthase subunit alpha  43.37 
 
 		 200 aa  167  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.599759  normal  0.02171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  41.43 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0768  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5294  riboflavin synthase, alpha subunit  50.48 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287836  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  51.28 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  47.76 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  40.72 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  49.26 
 
 		 207 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0989485 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  42.11 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3167  riboflavin synthase, alpha subunit  48.33 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3362  riboflavin synthase, alpha subunit  48.33 
 
 		 212 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  42.56 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  41.84 
 
 		 215 aa  165  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  48.5 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  48.19 
 
 		 202 aa  165  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 209 aa  165  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0239  riboflavin synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  51.47 
 
 		 204 aa  164  9e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  49.49 
 
 		 197 aa  164  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0130  riboflavin synthase subunit alpha  43.27 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0226834  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  48.77 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 223 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2883  riboflavin synthase subunit alpha  45.08 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.34702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0301  riboflavin synthase subunit alpha  44.06 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  42.71 
 
 		 204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3491  riboflavin synthase, alpha subunit  47.85 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 		 214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  41.24 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>