More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0239 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0239  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 202 aa  412  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0773  riboflavin synthase subunit alpha  76.12 
 
 		 202 aa  318  3e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  45.64 
 
 		 221 aa  177  8e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  44.62 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0130  riboflavin synthase subunit alpha  45.2 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0226834  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  44.1 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2384  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 		 200 aa  168  6e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.599759  normal  0.02171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  45.18 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  43.65 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  43.88 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  42.57 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  41.18 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 221 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  41 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  45.69 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  38.69 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  39.49 
 
 		 200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  44.62 
 
 		 219 aa  161  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  45.18 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  45.69 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 220 aa  160  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 196 aa  160  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  44.62 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  44.62 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  44.62 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  41.12 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  42.05 
 
 		 196 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  40.4 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2883  riboflavin synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.34702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  42.36 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  42.36 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  42.36 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  41.12 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  41.12 
 
 		 219 aa  158  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 199 aa  158  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  38.46 
 
 		 217 aa  157  7e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 217 aa  157  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  43.65 
 
 		 220 aa  157  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 200 aa  157  8e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 200 aa  157  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 218 aa  157  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  39.18 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  43.15 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  39.18 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  38.97 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3167  riboflavin synthase, alpha subunit  39.9 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  42.56 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  41.29 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  39.61 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  42.05 
 
 		 207 aa  154  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3362  riboflavin synthase, alpha subunit  39.52 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  41.38 
 
 		 218 aa  154  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  39.3 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  41.38 
 
 		 218 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3491  riboflavin synthase, alpha subunit  39.9 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  39.6 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  40.82 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  41.38 
 
 		 218 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  39.59 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  39.2 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 		 220 aa  151  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  40 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  39.8 
 
 		 204 aa  151  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  38.07 
 
 		 217 aa  150  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  43.15 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  38.28 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0989485 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  38.58 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  40.31 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  36.55 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  43.37 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  39.59 
 
 		 214 aa  148  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0632  riboflavin synthase subunit alpha  38.83 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  36.92 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  35.9 
 
 		 215 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  36.04 
 
 		 213 aa  148  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5294  riboflavin synthase, alpha subunit  36.45 
 
 		 213 aa  147  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287836  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  38.81 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  35.03 
 
 		 216 aa  147  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  36.55 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  34.87 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>