More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5294 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5294  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 213 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3101  riboflavin synthase, alpha subunit  85.5 
 
 		 211 aa  337  7e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00905036  decreased coverage  0.00949736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3362  riboflavin synthase, alpha subunit  75.12 
 
 		 212 aa  322  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3167  riboflavin synthase, alpha subunit  78.64 
 
 		 212 aa  321  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3491  riboflavin synthase, alpha subunit  77.18 
 
 		 212 aa  317  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  75.12 
 
 		 207 aa  308  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0989485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  64.73 
 
 		 207 aa  254  9e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  63.94 
 
 		 202 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  58.45 
 
 		 203 aa  229  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2527  riboflavin synthase subunit alpha  55.98 
 
 		 202 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.670524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0768  riboflavin synthase subunit alpha  55.5 
 
 		 202 aa  223  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0761  riboflavin synthase subunit alpha  55.5 
 
 		 202 aa  221  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1614  riboflavin synthase subunit alpha  59.05 
 
 		 204 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1180  riboflavin synthase subunit alpha  56.04 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1137  riboflavin synthase subunit alpha  56.74 
 
 		 204 aa  213  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1269  riboflavin synthase subunit alpha  53.62 
 
 		 203 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00443387  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3007  riboflavin synthase subunit alpha  54.33 
 
 		 202 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4646  riboflavin synthase subunit alpha  54.29 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.864914  normal  0.264101 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0819  riboflavin synthase subunit alpha  54.76 
 
 		 206 aa  205  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.311255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2637  riboflavin synthase subunit alpha  55.29 
 
 		 202 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23993  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1534  riboflavin synthase subunit alpha  54.33 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00190054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0632  riboflavin synthase subunit alpha  50.72 
 
 		 205 aa  202  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  53.4 
 
 		 200 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  55.45 
 
 		 197 aa  200  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1817  riboflavin synthase subunit alpha  52.4 
 
 		 202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35102  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  54.37 
 
 		 196 aa  198  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  53.95 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  54.37 
 
 		 198 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  53.88 
 
 		 198 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1724  riboflavin synthase subunit alpha  51.42 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.455199  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  52.63 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2674  riboflavin synthase subunit alpha  51.67 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00828025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2662  riboflavin synthase subunit alpha  51.44 
 
 		 202 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0632112  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  54.33 
 
 		 198 aa  187  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  50.24 
 
 		 196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  51.43 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  48.85 
 
 		 205 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  51.9 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  48.6 
 
 		 204 aa  174  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  44.76 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  50.48 
 
 		 215 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  45.93 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  50.48 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  46.54 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  49.02 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  49.02 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  45.85 
 
 		 220 aa  165  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  47.09 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  46.63 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  46.6 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  46.38 
 
 		 199 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  46.12 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 199 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  46.12 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  47.62 
 
 		 202 aa  158  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  45.63 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  46.63 
 
 		 221 aa  158  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  48.31 
 
 		 220 aa  158  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  45.1 
 
 		 216 aa  157  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  43.27 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  42.51 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  46.12 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  43.81 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  44.34 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  46.34 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  47.37 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  37.56 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  43.63 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  45.12 
 
 		 208 aa  154  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  46.41 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  45.66 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  42.86 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  44.93 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  42.11 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  46.34 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  44.34 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  47.95 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  43.48 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  45.24 
 
 		 201 aa  152  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  45.41 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  41.83 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  40.38 
 
 		 232 aa  151  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  44.61 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  40.67 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  44.93 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  43.81 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>