More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2637 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2637  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23993  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3007  riboflavin synthase subunit alpha  90.1 
 
 		 202 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2674  riboflavin synthase subunit alpha  88.12 
 
 		 202 aa  362  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00828025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4646  riboflavin synthase subunit alpha  78.71 
 
 		 202 aa  330  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.864914  normal  0.264101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2662  riboflavin synthase subunit alpha  79.21 
 
 		 202 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0632112  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1817  riboflavin synthase subunit alpha  77.72 
 
 		 202 aa  315  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35102  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1724  riboflavin synthase subunit alpha  75.12 
 
 		 209 aa  300  8.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.455199  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  61.39 
 
 		 202 aa  246  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  61 
 
 		 207 aa  237  8e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1137  riboflavin synthase subunit alpha  60.7 
 
 		 204 aa  229  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  58.82 
 
 		 203 aa  218  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1614  riboflavin synthase subunit alpha  57.92 
 
 		 204 aa  212  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  55.45 
 
 		 200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  56.52 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0989485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0819  riboflavin synthase subunit alpha  55.45 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.311255 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0761  riboflavin synthase subunit alpha  52.71 
 
 		 202 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1180  riboflavin synthase subunit alpha  55.17 
 
 		 203 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1269  riboflavin synthase subunit alpha  55.67 
 
 		 203 aa  205  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00443387  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5294  riboflavin synthase, alpha subunit  55.29 
 
 		 213 aa  205  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287836  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  55 
 
 		 196 aa  205  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0768  riboflavin synthase subunit alpha  52.22 
 
 		 202 aa  204  6e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2527  riboflavin synthase subunit alpha  52.71 
 
 		 202 aa  204  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.670524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  54.46 
 
 		 197 aa  203  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0632  riboflavin synthase subunit alpha  51.72 
 
 		 205 aa  201  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  54.85 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3362  riboflavin synthase, alpha subunit  54.55 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3101  riboflavin synthase, alpha subunit  55.45 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00905036  decreased coverage  0.00949736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3167  riboflavin synthase, alpha subunit  54.55 
 
 		 212 aa  198  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3491  riboflavin synthase, alpha subunit  54.07 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  54.73 
 
 		 198 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1534  riboflavin synthase subunit alpha  51.49 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00190054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  52.24 
 
 		 198 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  52.24 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  48.79 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  49.49 
 
 		 196 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  51.18 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  49.28 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  50.49 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  47.6 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 221 aa  171  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  47.98 
 
 		 219 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  47.98 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  46.97 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 220 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  44.95 
 
 		 216 aa  160  8.000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  43.96 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  46.46 
 
 		 227 aa  158  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 221 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  43.28 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 218 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  44.72 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 218 aa  151  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 230 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  41.5 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  42.71 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  44.06 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  44.22 
 
 		 221 aa  148  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  39.9 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 199 aa  148  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  45.96 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  43.56 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  44.28 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 		 217 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  42.36 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0714  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 217 aa  141  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.854328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  44.22 
 
 		 200 aa  140  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  41.54 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>