More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2662 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2662  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0632112  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2674  riboflavin synthase subunit alpha  79.21 
 
 		 202 aa  332  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00828025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4646  riboflavin synthase subunit alpha  77.72 
 
 		 202 aa  328  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.864914  normal  0.264101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2637  riboflavin synthase subunit alpha  79.21 
 
 		 202 aa  325  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23993  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3007  riboflavin synthase subunit alpha  77.72 
 
 		 202 aa  321  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1817  riboflavin synthase subunit alpha  73.76 
 
 		 202 aa  305  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35102  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1724  riboflavin synthase subunit alpha  70.15 
 
 		 209 aa  289  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.455199  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  58 
 
 		 207 aa  224  8e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  56.93 
 
 		 202 aa  222  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  56.37 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1137  riboflavin synthase subunit alpha  57.43 
 
 		 204 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1180  riboflavin synthase subunit alpha  53.2 
 
 		 203 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1534  riboflavin synthase subunit alpha  51.49 
 
 		 201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00190054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  53.62 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0989485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3362  riboflavin synthase, alpha subunit  53.11 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0819  riboflavin synthase subunit alpha  51.98 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.311255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3167  riboflavin synthase, alpha subunit  53.11 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3101  riboflavin synthase, alpha subunit  53.47 
 
 		 211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00905036  decreased coverage  0.00949736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  53.5 
 
 		 196 aa  194  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0632  riboflavin synthase subunit alpha  48.77 
 
 		 205 aa  194  8.000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3491  riboflavin synthase, alpha subunit  53.11 
 
 		 212 aa  194  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  52.97 
 
 		 200 aa  194  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1269  riboflavin synthase subunit alpha  52.22 
 
 		 203 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00443387  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1614  riboflavin synthase subunit alpha  51.98 
 
 		 204 aa  192  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0761  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 202 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2527  riboflavin synthase subunit alpha  50.74 
 
 		 202 aa  192  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.670524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0768  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 202 aa  191  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  50.51 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  52.97 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  53.4 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5294  riboflavin synthase, alpha subunit  51.44 
 
 		 213 aa  188  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287836  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  49.76 
 
 		 205 aa  187  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 207 aa  187  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  51.69 
 
 		 204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  52.24 
 
 		 198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  52.74 
 
 		 198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  52.24 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  52.13 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  51.23 
 
 		 205 aa  181  9.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  47.74 
 
 		 219 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  47.29 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  45.96 
 
 		 230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 		 219 aa  161  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  44.22 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  46.77 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  47.24 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  44.55 
 
 		 220 aa  157  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  44.55 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  44.06 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  41.29 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  44.33 
 
 		 223 aa  154  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 217 aa  154  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 199 aa  154  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  42.03 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  44.55 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  48 
 
 		 209 aa  152  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  40.7 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  43.07 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  42.21 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 218 aa  151  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  44.72 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  45.45 
 
 		 227 aa  151  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 209 aa  151  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  40.4 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  44 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  44.06 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  43.14 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  44.28 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 197 aa  148  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 223 aa  148  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  42.64 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  42.64 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  44.22 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  39.7 
 
 		 218 aa  147  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  41.21 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  41 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>